Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  376  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114603105--114603391
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136
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1
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3
4
28
1.30
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0
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0
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2.1
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4
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1.36
114606149--114606615
3
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1.20
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0
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18
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4
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0
0
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12
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28
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33
2
5
58
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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114643410--114643505
2
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2
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12
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6
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1.32
114643406--114643509
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10.7
10
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20
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0
7
54
1.36
114643414--114643515
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3.0
33
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5
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35
0
6
56
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1.8
141
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12
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2
5
58
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19
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4
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3
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90
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0
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0
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114658301--114658349
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2
62
36
0
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1.17
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3
4
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1.35
114658430--114658492
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3.3
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73
20
55
36
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4
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1.30
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8
400
32
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2.8
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63
1.34
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96
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2.0
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3
42
1.37
114664510--114664553
21
2.1
21
83
8
54
70
4
4
20
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114664611--114664659
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2.3
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1.64
114670154--114670207
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2.1
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24
14
24
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1.93
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2.1
26
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99
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37
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19.5
2
100
0
78
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0
0
51
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2.0
24
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24
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52
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1
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1.20
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26
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24
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50
32
2
16
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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1
15
1.54
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172
2.1
173
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4
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44
22
1
31
1.60
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33
2.2
33
87
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103
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4
49
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48
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48
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0
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20
1.93
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0
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27
25
25
22
2.00
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21
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1.95
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26
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0
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1.01
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0
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0
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1.78
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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0
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2.0
72
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0
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28
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1.94
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1.97
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0
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1.97
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48
6.9
48
72
10
286
29
24
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.82
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30
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19
1.97
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4.1
27
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1.91
114788327--114788438
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2.1
54
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22
23
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1.91
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10
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27
28
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2.0
54
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50
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13
100
0
56
46
14
7
32
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114842092--114842165
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28
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0
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0
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2
365
21
14
19
43
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410