Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  348  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107322875--107323064
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4.4
43
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0
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18
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31
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1.31
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3.0
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182
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25
16
1.94
107340583--107340649
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2.2
26
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25
10
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2.0
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100
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26
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51
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2.4
19
81
14
56
56
0
2
40
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
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17
28
1.91
107396011--107396069
30
2.0
30
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6
84
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6
32
1.34
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3
19.3
3
92
3
100
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3
32
1.10
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1.9
31
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10
86
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18
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2.0
44
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35
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2.0
333
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1.89
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147
12
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1.93
107447340--107447373
2
17.5
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61
50
0
0
50
1.00
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84
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56
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0
47
1.22
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2.2
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107
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1.99
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13
100
0
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55
7
0
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1.28
107461282--107461373
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2.2
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118
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20
20
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1.98
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72
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65
36
23
28
11
1.89
107465969--107466095
39
3.3
39
89
2
202
39
22
25
13
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
1.88
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2.9
12
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52
20
17
20
42
1.89
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18
2.6
19
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64
22
16
18
42
1.88
107479099--107479209
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3.3
34
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150
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36
1.77
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2.0
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0
144
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16
15
43
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0
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0
315
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23
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1.91
107548152--107548417
138
2.0
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1.92
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107
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1
5
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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25
44
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107647004--107647102
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7.0
25
75
18
135
34
23
6
35
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410