Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  334  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103564487--103564894
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18
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103564493--103564894
140
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25
30
18
25
1.98
103582152--103582320
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0
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1
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1.38
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20
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2.0
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0
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2.0
132
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379
28
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19
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2
2
28
1.19
103610271--103610337
9
7.3
9
78
20
52
35
1
1
61
1.15
103610267--103610336
10
7.1
11
75
18
57
37
1
1
60
1.15
103610268--103610336
19
3.5
20
81
13
81
36
1
1
60
1.14
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0
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0
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0
0
50
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2.0
26
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0
86
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0
0
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32
2.5
32
79
2
97
48
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13
28
1.72
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6.3
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100
0
76
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0
0
18
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119
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9
56
1.50
103651126--103651208
37
2.2
38
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2
114
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3
10
55
1.51
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2.0
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76
38
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7
53
1.29
103652926--103652974
22
2.2
22
82
7
55
42
2
6
48
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
17
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2.3
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19
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12
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1.89
103655034--103655151
59
2.0
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218
23
23
15
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1.93
103659140--103659225
37
2.3
37
94
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147
40
4
32
22
1.74
103659315--103659394
35
2.3
35
84
0
97
38
18
17
25
1.92
103660986--103661035
25
2.0
25
84
7
66
32
24
18
26
1.97
103662248--103662328
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2.0
42
87
2
119
20
20
38
19
1.94
103662231--103662339
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2.6
41
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1
146
21
22
37
18
1.94
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16
2.1
16
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15
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0
0
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2.0
609
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19
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26
27
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0
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38
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57
1.23
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43
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11
127
25
18
23
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103705897--103706053
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24
19
24
31
1.98
103710539--103710668
27
4.8
27
87
2
154
29
25
11
33
1.91
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52
3.0
52
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2
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23
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28
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1.97
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0
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16
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2.7
44
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2
135
32
29
16
21
1.95
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2
24.0
2
91
4
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2
0
51
1.13
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43
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1
140
31
16
25
26
1.96
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2.8
26
77
8
76
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14
19
32
1.92
103753215--103753381
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0
2
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0
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0
2
58
1.10
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16
100
0
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32
1.73
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2.3
34
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0
140
45
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7
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1.54
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1.48
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0
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1.52
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2
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2
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0
0
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1.00
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0
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19
10
35
1.87
103776612--103776637
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3.7
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100
0
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26
0
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0
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30
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7
1.72
103777671--103778041
129
2.9
127
90
4
572
36
4
4
54
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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18.0
46
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2
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14
23
22
1.90
103789643--103790465
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6.0
138
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1212
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14
23
22
1.90
103789643--103790460
183
4.5
184
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2
1220
40
14
23
22
1.90
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19
4.0
22
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15
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1
6
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1.32
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18.0
46
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2
1201
40
13
23
22
1.90
103795547--103796368
137
6.0
138
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2
1185
40
13
23
22
1.90
103795557--103796368
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4.4
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2
1198
40
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23
22
1.90
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21
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1.98
103810349--103810476
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215
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27
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21
29
1.98
103818430--103818581
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71
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27
21
21
29
1.98
103818430--103818581
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3
227
27
21
21
29
1.98
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2.3
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25
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1.96
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2.1
16
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10
52
55
0
8
35
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103821698--103821888
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18
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1.83
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0
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0
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1.9
13
100
0
50
16
24
24
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410