Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  332  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102945565--102945836
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2.0
135
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1
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25
18
25
31
1.98
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5.2
26
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0
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5
25
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1.78
102952217--102952490
136
2.0
136
97
0
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25
18
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1.98
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2
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0
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0
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100
0
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50
0
0
50
1.00
102954194--102954238
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4
0
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1.22
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7
4
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1.32
102961424--102961528
49
2.1
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3
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18
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9
100
0
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11
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19
19
30
30
1.96
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2.1
24
100
0
102
21
23
27
27
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18
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1
0
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1.11
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17
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14
57
50
2
0
47
1.12
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19
2.5
22
76
17
58
59
5
0
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1.21
103021219--103021280
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2.1
30
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11
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38
1
6
53
1.37
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2
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2
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0
0
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1.00
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0
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21
25
1.95
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31
5.8
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2
272
26
20
28
25
1.99
103025083--103025297
47
4.7
46
83
7
204
29
15
26
28
1.96
103025134--103025297
49
3.6
48
84
9
193
30
15
26
28
1.96
103025177--103025340
42
3.7
43
83
9
172
31
15
25
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103025981--103026031
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2.2
23
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0
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41
7
17
33
1.79
103026916--103026997
41
2.0
42
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4
121
29
12
3
54
1.54
103027811--103027857
4
11.5
4
78
13
51
17
0
8
74
1.05
103027800--103027857
16
3.5
16
79
13
55
17
3
8
70
1.26
103027814--103027853
20
2.0
20
90
9
64
15
0
10
75
1.05
103027800--103027857
13
4.7
12
79
12
55
17
3
8
70
1.26
103027815--103027868
24
2.3
23
84
12
65
18
0
7
74
1.05
103027967--103028040
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5.0
16
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56
18
5
0
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55
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4
0
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113
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3
61
1.37
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19
2.1
19
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0
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42
2
5
50
1.37
103039329--103039373
19
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18
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2
6
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1.41
103053686--103053796
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2.5
45
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0
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1.92
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2.6
27
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0
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42
12
21
23
1.87
103062483--103062528
21
2.2
21
92
0
74
28
19
36
15
1.92
103064773--103064819
25
1.9
24
87
12
69
61
2
2
34
1.20
103073728--103073798
35
2.0
35
100
0
142
50
11
8
29
1.67
103073887--103073934
24
2.0
24
95
0
87
54
31
6
8
1.55
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2
100
0
54
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0
0
51
1.00
103081007--103081036
15
2.0
15
100
0
60
33
46
6
13
1.69
103081324--103081384
18
3.4
17
76
17
61
40
11
11
36
1.77
103088907--103089079
43
4.0
43
82
10
219
21
16
28
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103090028--103090063
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2
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0
72
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0
0
50
1.00
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2.0
26
100
0
102
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3
15
39
1.66
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13
1.9
13
100
0
50
20
40
24
16
1.91
103097972--103098016
22
2.0
22
100
0
90
33
17
4
44
1.69
103108620--103108650
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
103108730--103108760
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1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
103109932--103109965
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5
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12
52
14
0
2
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1.9
28
88
0
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38
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1
46
1.53
103111326--103111385
28
2.1
28
81
0
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40
13
3
43
1.60
103111572--103111684
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2.3
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4
131
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21
20
16
1.90
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2.3
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9
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0
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1.43
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13
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12
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1.00
103112733--103112764
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12
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9
9
0
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0.88
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2.5
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0
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20
0.96
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21
2.1
21
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59
0
9
31
1.29
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28
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114
29
13
26
29
1.94
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29
2.5
28
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13
26
29
1.94
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14
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2
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0
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20
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0
77
0.90
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3.1
15
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0
67
17
6
2
74
1.12
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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25
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20
381
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12
2
33
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
593
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83
33
9
22
34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.8
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82
6
214
26
23
17
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410