Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  8  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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100
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2.1
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25
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2.7
29
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20
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2.8
12
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0
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21
0
30
48
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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0
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17
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50
27
0
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0
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0
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30
0
3
66
1.06
2157981--2158032
15
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10
61
34
0
1
63
1.06
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34
2.2
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2
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9
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38
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2173139--2173370
105
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100
80
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31
17
23
27
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0
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27
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2.2
26
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62
31
29
24
14
1.94
2182355--2182413
18
3.3
19
84
15
81
52
3
1
42
1.28
2182379--2182426
18
2.5
20
83
10
64
58
4
2
35
1.29
2182753--2182795
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2.8
16
82
10
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51
0
0
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0
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2.3
30
78
4
79
45
7
8
38
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
2.0
37
84
7
98
16
9
2
72
1.22
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23
2.3
23
83
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61
17
5
0
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20
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2
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2
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14
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1.76
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2.4
22
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54
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33
1.47
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0
0
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0
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2
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14
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1.42
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14
2.4
14
85
15
50
72
15
12
0
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2251380--2251430
24
2.2
22
89
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33
1
3
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1.26
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0
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29
1.55
2264025--2264095
19
4.1
16
77
16
52
56
1
4
38
1.28
2264036--2264095
19
3.4
17
76
17
59
58
0
3
38
1.15
2264066--2264109
21
2.2
20
83
4
52
65
4
0
29
1.12
2264301--2264330
3
10.0
3
92
0
51
63
0
3
33
1.11
2264426--2264473
23
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22
84
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60
58
10
2
29
1.43
2264446--2264499
3
18.0
3
77
7
56
61
5
1
31
1.30
2264965--2265009
23
2.0
22
86
4
63
37
0
62
0
0.96
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53
2.1
53
100
0
222
37
15
22
24
1.93
2266229--2266261
15
2.2
15
94
0
57
69
3
6
21
1.24
2266180--2266604
89
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89
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35
19
17
27
1.94
2266548--2266746
72
2.7
73
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3
283
30
21
19
29
1.97
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76
2.9
76
87
0
320
29
21
17
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16
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16
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3
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16
1.42
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16
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13
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13
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0
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0
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1.39
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19
4.1
16
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16
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56
1
4
38
1.28
2276868--2276927
19
3.4
17
76
17
59
58
0
3
38
1.15
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21
2.2
20
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4
52
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4
0
29
1.12
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3
11.0
3
93
0
57
63
0
3
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
24.3
3
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8
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5
1
31
1.26
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11
3.9
11
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13
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15
0
2
81
0.78
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19
2.0
20
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5
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17
0
2
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10
4.9
10
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7
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14
0
4
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0
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0
0
50
1.00
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2.2
18
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0
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2
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21
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0
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0
5
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1.11
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2.0
43
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0
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20
2.2
19
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8
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34
0
2
63
1.08
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22
2.4
21
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16
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34
2
2
62
1.18
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20
2.1
20
86
8
59
33
2
2
61
1.21
2294063--2294109
20
2.2
22
77
7
53
36
2
2
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1.21
2294877--2294965
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2.9
29
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9
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1.50
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3
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3
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0
141
0
34
0
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1.9
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20
6
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1.77
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153
4.5
153
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3
1015
26
22
22
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1.99
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77
2.0
77
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0
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19
14
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34
2.0
34
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3
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12
1
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1.51
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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0
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18
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3
0
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1.03
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15
2.6
15
83
0
51
64
2
7
25
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2341786--2341837
26
2.0
26
96
0
95
48
7
13
30
1.71
2351880--2352086
42
4.7
43
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13
181
29
27
14
28
1.95
2351908--2352086
49
3.9
48
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10
196
30
28
13
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1.94
2351965--2352129
47
3.5
47
84
5
165
30
27
15
26
1.96
2351924--2352129
49
4.5
47
82
7
183
30
27
14
27
1.95
2352162--2352310
31
4.8
31
93
0
244
25
27
20
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1.99
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26
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0
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0
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4.8
9
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9
9
0
81
0.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410