Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  176  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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21
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21
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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27
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1.56
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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24
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1.07
Indices
Period
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A
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(0-2)
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19
3
1.04
54207976--54208032
16
3.6
16
75
17
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75
1
19
3
1.04
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12
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0
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12
29
1.80
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12
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12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
54208107--54208162
18
3.1
18
76
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51
69
3
19
7
1.27
54208113--54208194
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1
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19
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14
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54212012--54212106
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54212051--54212084
18
1.9
18
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23
23
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1.95
54213763--54213812
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2.0
26
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4
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1.38
54213791--54213829
19
2.2
18
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12
1.20
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3
1.00
54214744--54214800
5
11.0
5
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77
1
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1.00
54214744--54214800
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14
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1.00
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1.80
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30
3.3
30
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0
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29
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15
2.1
15
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0
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18
50
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11
3.9
11
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8
72
71
8
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15
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54220451--54220496
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24
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8
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10
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100
0
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2.1
26
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0
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21
2.0
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100
0
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54239457--54239495
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0
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0
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2.0
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12
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21
90
4
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19
16
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
54250476--54250509
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11
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27
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2
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0.95
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1
25
15
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410