Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  409  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123412049--123412101
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0
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2.0
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28
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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105
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12
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1.64
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30
2.7
30
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11
11
52
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1.70
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24
2.6
23
80
12
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3
4
45
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
16
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0
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216
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21
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0
192
33
40
4
21
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
93
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3
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31
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19
1.74
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21
2.4
21
86
0
66
35
41
5
17
1.74
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129
2.0
129
94
1
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5
19
1.73
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7.9
36
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1
347
28
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4
22
1.73
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10
406
27
49
11
11
1.74
123604513--123604841
93
3.5
93
85
8
445
27
50
11
11
1.72
123605419--123605487
29
2.3
29
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46
7
10
36
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20
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19
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1.60
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0
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1.23
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0
50
1.22
123630108--123630171
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2.7
24
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4
0
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1.22
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10
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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1.00
123649363--123649421
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0
0
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17
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21
1.9
20
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15
53
0
12
10
76
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.41
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1.75
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2.1
66
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33
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0
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1.80
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0
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18
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2
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2.4
297
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0
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0
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1.95
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2.7
46
95
1
216
20
23
27
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123703219--123703479
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15
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2.0
42
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0
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0
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0
0
0.00
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2.1
48
96
0
182
60
10
11
19
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410