Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  315  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97817838--97818076
53
4.6
52
75
14
179
58
5
5
31
1.42
97817698--97818090
26
15.2
25
69
16
198
59
5
6
29
1.45
97817925--97818076
50
2.9
52
80
8
159
57
5
5
31
1.43
97820229--97820297
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
97824654--97824706
18
2.9
17
72
10
52
18
26
3
50
1.64
97827646--97827704
31
1.9
31
89
0
91
50
13
16
18
1.77
97832277--97832310
17
2.0
17
88
0
50
29
5
41
23
1.78
97833645--97833705
18
3.4
17
73
24
54
44
1
1
52
1.20
97836324--97836377
16
3.2
16
92
5
81
11
0
33
55
1.35
97836577--97837086
126
4.1
126
86
3
644
38
16
16
29
1.91
97836577--97837090
251
2.1
244
83
4
636
37
16
16
28
1.91
97840496--97840534
18
2.2
18
85
0
51
46
10
20
23
1.81
97849719--97849744
12
2.2
12
100
0
52
0
7
0
92
0.39
97852378--97852425
6
8.2
6
88
4
71
31
0
0
68
0.90
97852373--97852448
17
4.5
17
75
11
75
32
1
0
65
1.01
97852381--97852449
12
5.6
12
77
17
52
33
1
0
65
1.02
97860663--97860692
15
1.9
16
93
6
53
46
0
6
46
1.29
97864192--97864216
13
1.9
13
100
0
50
56
16
12
16
1.68
97867772--97867803
15
2.1
15
100
0
64
46
34
12
6
1.67
97870063--97870123
24
2.5
24
100
0
122
19
18
26
36
1.94
97874650--97874798
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
97874691--97874798
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97878130--97878238
54
2.0
54
98
0
209
34
29
12
22
1.92
97882238--97882275
20
1.9
20
84
10
51
44
18
2
34
1.64
97887662--97887735
36
2.1
36
97
0
139
33
13
0
52
1.41
97924238--97924361
40
3.1
40
72
8
108
25
15
26
33
1.95
97927092--97927205
24
4.9
23
77
13
108
36
19
22
21
1.95
97927089--97927205
47
2.5
47
83
5
139
37
19
22
20
1.94
97927535--97927596
30
2.1
30
96
0
115
40
12
4
41
1.65
97930908--97931091
67
2.8
64
79
8
203
29
16
30
23
1.96
97932178--97932202
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
97938165--97938221
10
5.9
10
76
13
57
68
1
10
19
1.28
97938455--97938517
32
2.0
32
100
0
126
41
15
12
30
1.85
97941361--97941436
7
11.0
7
75
23
56
72
1
3
22
1.09
97941359--97941434
25
3.2
24
77
14
77
73
1
3
21
1.06
97941369--97941433
10
6.2
10
76
18
53
73
1
3
21
1.05
97944909--97944974
30
2.2
30
89
2
107
21
27
3
48
1.64
97945006--97945057
26
2.0
26
100
0
104
46
15
11
26
1.80
97953588--97953815
114
2.0
113
93
0
393
33
11
28
26
1.91
97958039--97958109
36
2.0
36
100
0
142
25
5
21
47
1.72
97959020--97959118
51
2.0
49
84
9
130
51
8
28
12
1.67
97964953--97965007
19
2.9
18
86
10
74
41
14
3
40
1.63
97972155--97972195
3
13.7
3
100
0
82
34
0
0
65
0.93
97975005--97975098
49
1.9
49
93
0
161
42
17
14
25
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97978161--97978231
25
2.8
25
80
4
72
40
8
16
33
1.79
97978175--97978238
25
2.6
25
82
0
74
40
9
17
32
1.81
97979345--97979447
49
2.1
49
100
0
206
11
25
3
59
1.49
97979649--97979683
18
1.9
18
88
11
54
11
17
2
68
1.31
97979649--97979682
17
1.9
18
88
5
52
11
17
2
67
1.34
97983032--97983152
58
2.1
58
100
0
242
34
9
19
35
1.85
97983262--97983331
35
2.0
35
100
0
140
31
20
2
45
1.65
97984904--97984937
16
2.1
16
94
0
59
5
20
29
44
1.75
97991834--97991956
61
2.0
61
96
0
228
31
27
11
29
1.91
97995505--97995596
28
3.3
27
84
7
103
25
32
11
30
1.92
97999844--97999875
16
2.0
16
93
0
55
78
0
6
15
0.95
97999885--97999921
13
2.8
13
92
8
58
78
0
5
16
0.93
97999885--97999922
20
1.9
20
89
10
60
76
0
7
15
1.01
98012493--98012541
23
2.1
23
84
3
62
24
18
12
44
1.84
98014428--98014486
7
8.4
7
81
10
50
62
0
0
37
0.95
98014416--98014481
27
2.4
27
71
19
64
62
0
0
37
0.96
98014945--98014998
26
2.1
26
86
6
74
29
0
1
68
1.00
98014987--98015034
19
2.5
19
86
0
60
29
2
6
62
1.31
98027429--98027562
46
2.9
46
95
0
232
27
29
22
20
1.98
98029943--98030031
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
98029943--98030022
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
98029954--98030031
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98032989--98033161
93
1.9
93
96
0
319
27
30
21
20
1.98
98032981--98033156
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
98034550--98034772
47
4.8
48
86
9
238
28
29
21
21
1.98
98034628--98034706
27
3.2
27
60
29
66
26
29
20
24
1.99
98034604--98034775
47
3.7
47
89
6
253
27
29
20
21
1.98
98039840--98039879
19
2.1
19
90
0
62
45
12
7
35
1.70
98043585--98043760
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
98043581--98043752
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
98046715--98046783
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
98046706--98046793
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
98048708--98048883
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
98048704--98048875
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
98055071--98055164
42
2.2
43
83
5
111
29
23
20
26
1.99
98059438--98059633
50
3.9
49
80
4
214
26
17
27
28
1.98
98059836--98059872
16
2.1
19
85
14
53
48
2
21
27
1.63
98062706--98063024
48
6.6
48
85
0
386
26
31
18
23
1.98
98067885--98067932
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
98067976--98068034
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
98067980--98068034
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
98068085--98068204
24
5.0
24
90
3
170
28
22
22
26
1.99
98068377--98068469
31
3.1
31
92
6
163
38
16
22
22
1.92
98075734--98075781
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98075825--98075883
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
98075829--98075883
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
98075934--98076076
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
98075934--98076076
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
98075934--98076077
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
98076268--98076362
31
3.1
31
93
0
163
40
14
22
23
1.91
98078931--98078986
11
5.6
10
79
12
62
35
10
17
35
1.85
98078949--98078986
20
1.9
20
100
0
76
36
10
18
34
1.85
98079031--98079103
25
3.0
24
79
4
65
27
23
24
24
2.00
98086834--98086871
20
1.9
20
94
0
67
36
10
21
31
1.87
98086816--98086871
11
5.6
10
75
12
53
35
10
19
33
1.87
98100596--98100725
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
98103697--98103735
8
4.6
8
81
12
51
56
2
0
41
1.13
98103697--98103740
12
3.5
12
81
6
52
56
2
0
40
1.11
98104594--98104712
41
2.8
43
85
5
170
30
24
17
27
1.97
98104592--98104729
43
3.3
42
80
9
165
29
23
18
28
1.97
98104575--98104732
84
1.9
84
85
5
221
30
25
17
26
1.97
98106121--98106154
16
2.1
17
89
10
54
29
17
0
52
1.45
98108868--98108985
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
98108891--98108985
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
98109177--98109318
24
6.0
24
90
5
200
26
22
21
28
1.99
98109177--98109317
46
3.0
48
88
7
198
26
22
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98109369--98109422
11
5.4
11
70
20
55
31
20
11
37
1.88
98109369--98109427
19
3.0
20
95
5
111
33
20
10
35
1.86
98115607--98115724
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
98115630--98115724
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
98115916--98116057
24
6.0
24
90
5
200
26
22
21
28
1.99
98115916--98116056
46
3.0
48
88
7
198
26
22
21
28
1.99
98116108--98116167
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
98116108--98116162
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
98124674--98124809
29
4.7
29
86
3
157
24
30
15
29
1.95
98124649--98124808
58
2.8
58
81
0
176
23
33
15
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410