Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  88  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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29
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
25887224--25887473
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
25895400--25895609
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
25900727--25900828
29
3.6
27
78
7
89
26
31
17
24
1.97
25907286--25907420
29
4.7
29
92
0
216
31
15
22
29
1.95
25910309--25910477
92
1.8
92
83
8
229
24
17
10
46
1.80
25911170--25911197
2
14.0
2
100
0
56
0
0
50
50
1.00
25914418--25914462
19
2.3
20
92
3
74
28
8
11
51
1.68
25914544--25914584
16
2.6
16
96
0
73
48
0
0
51
1.00
25919136--25919184
2
24.5
2
87
0
71
48
0
6
44
1.27
25919884--25919981
38
2.6
37
85
3
124
39
13
16
30
1.87
25921838--25921870
14
2.3
15
89
5
50
24
15
6
54
1.63
25925811--25925957
42
3.1
42
65
26
105
40
3
18
38
1.67
25925799--25925999
100
2.0
100
99
0
393
41
2
18
37
1.66
25937254--25937322
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
25939109--25939152
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
25941527--25941595
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
25943385--25943428
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
25947784--25947827
20
2.2
20
92
8
72
56
0
2
40
1.11
25949250--25949317
26
2.7
26
86
2
84
30
20
13
35
1.91
25953292--25953459
40
4.2
40
82
3
178
25
26
22
26
2.00
25959703--25959877
48
3.7
46
69
14
126
24
29
19
26
1.98
25962451--25962510
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25962507--25962548
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
25962581--25962632
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
25969561--25969828
47
5.7
46
72
11
172
20
28
20
29
1.98
25972611--25972727
58
2.0
58
100
0
234
29
37
14
18
1.91
25975721--25975766
18
2.6
18
86
10
60
76
2
15
6
1.09
25976847--25976879
6
5.5
6
96
0
57
30
18
3
48
1.63
25977012--25977060
18
2.7
18
83
0
62
44
12
16
26
1.82
25977011--25977070
18
3.3
18
75
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59
43
11
15
30
1.82
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4.2
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2
17
2
0.99
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11
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13
69
24
50
69
4
21
4
1.24
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15
2.0
15
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0
51
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0
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3
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32
0
0
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0.91
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20
2.3
20
92
0
74
28
17
23
30
1.97
25983229--25983268
20
2.0
20
100
0
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20
25
25
1.99
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21
17
18
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1.90
25983368--25983400
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5.5
6
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0
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48
1.63
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2.5
18
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0
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26
2
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1.67
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18
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19
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13
56
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10
13
31
1.76
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46
2.0
46
100
0
186
30
29
21
19
1.97
25993022--25993271
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
26006441--26006510
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
26012798--26012833
18
1.9
19
88
5
56
72
5
11
11
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26013065--26013114
25
2.0
26
84
11
68
36
4
8
52
1.50
26022425--26022472
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
26022516--26022574
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
26022520--26022574
11
5.4
11
70
16
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38
10
20
30
1.87
26022624--26022766
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
26022624--26022766
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
26022624--26022767
71
2.0
72
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4
220
29
22
22
26
1.99
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3.1
31
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25
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0
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25
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1.96
26029132--26029190
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410