Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  237  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.98
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2
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1.9
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228
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22
59
28
21
20
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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19
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17
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2.0
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0
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10
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11
79
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1
8
21
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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1.16
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37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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277
35
16
10
36
1.84
73441556--73441720
54
3.0
55
94
2
278
35
16
10
36
1.84
73443881--73443930
7
7.0
7
82
13
66
44
0
14
42
1.44
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36
1.9
35
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3
100
41
2
13
42
1.59
73443882--73443939
29
2.0
29
93
6
100
43
0
13
43
1.44
73444162--73444233
5
14.4
5
71
0
54
40
5
15
38
1.70
73444162--73444227
20
3.3
20
86
0
87
39
6
15
39
1.72
73457612--73457722
55
2.0
55
100
0
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21
3
25
49
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73459799--73460036
130
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9
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43
1.64
73461490--73461524
17
2.1
17
100
0
70
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0
34
1.54
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39
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23
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22
1.99
73470893--73471201
39
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39
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2
534
22
30
25
21
1.99
73476803--73477191
39
10.1
39
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1
651
22
29
25
21
1.99
73476795--73477191
154
2.6
154
94
3
683
23
28
25
22
1.99
73482076--73482262
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3.8
49
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4
252
30
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17
26
1.97
73482089--73482270
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321
29
27
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25
1.97
73484222--73484442
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5.6
40
90
2
322
27
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27
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1.99
73498357--73498423
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2.5
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0
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1.82
73506908--73507155
80
3.1
79
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3
309
23
26
22
27
2.00
73506908--73507113
40
5.2
40
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2
308
21
28
23
26
1.99
73506908--73507155
40
6.2
40
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2
216
23
26
22
27
2.00
73506908--73507155
120
2.1
120
83
3
320
23
26
22
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
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8
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40
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28
2.1
28
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0
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1.90
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10
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1.89
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30
2.1
30
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0
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1.95
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1.9
22
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19
17
0
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1.31
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2.0
22
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39
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0
2
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2.0
80
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13
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73581553--73581731
80
2.2
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44
2
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44
2.0
44
100
0
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22
24
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1.92
73597974--73598068
40
2.4
40
83
1
129
31
13
24
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73603401--73603445
20
2.2
20
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0
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15
4
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1.65
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1.9
23
86
4
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22
20
15
42
1.89
73624427--73624576
41
3.7
41
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203
29
27
22
20
1.99
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3.7
41
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28
28
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1.99
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0
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0
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1.98
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0
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1.96
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29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410