Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  164  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.2
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0
263
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20
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23
1.97
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0
253
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22
1.96
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203
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176
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28
18
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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105
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24
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0
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4
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20
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20
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20
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181
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20
18
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1.96
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181
3.7
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20
17
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1.96
50113381--50113693
97
3.4
96
74
12
319
27
20
17
34
1.95
50113438--50113732
43
6.6
43
71
11
182
28
22
17
31
1.97
50116222--50116392
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240
24
20
29
25
1.99
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2.6
137
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1
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11
1
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0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.71
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2.8
28
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12
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2.0
24
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100
0
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0
12
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2.0
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1
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50123920--50123970
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12
87
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78
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1
15
0.99
50123920--50123962
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2.6
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22
22
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50161309--50161339
6
5.0
6
92
7
53
19
16
16
48
1.81
50163956--50164066
43
2.6
43
83
7
138
27
21
25
26
2.00
50168364--50168428
27
2.4
27
92
0
103
21
26
13
38
1.91
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31
4.5
31
82
0
174
27
25
16
30
1.96
50168485--50168632
62
2.4
62
84
0
197
27
25
16
30
1.97
50168625--50168737
33
3.5
33
83
7
106
28
23
11
37
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50168650--50168737
33
2.7
33
87
8
119
26
21
11
40
1.87
50170409--50170471
31
2.0
31
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0
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0
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2.1
56
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26
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29
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28
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28
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0
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29
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198
21
21
28
27
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21
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1.99
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20
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0
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2
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1.27
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198
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21
28
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1.99
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21
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1.99
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11
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11
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0
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1.98
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1.98
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114
3.2
114
91
4
591
50
16
0
32
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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5
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0
36
0
63
0.95
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45
4.6
45
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1
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20
27
27
1.99
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2.8
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23
21
28
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1.99
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2.3
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18
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2.0
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1.98
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3.7
38
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0
210
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21
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1.98
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48
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2.0
108
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38
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23
22
24
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1.99
50257863--50258173
116
2.7
114
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424
23
22
24
29
1.99
50257863--50258173
154
2.0
154
92
1
516
23
22
24
29
1.99
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0
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0
0
50
1.00
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25
24
25
24
2.00
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2.0
80
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24
23
2.00
50270700--50270773
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2.0
37
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1.92
50274726--50274828
46
2.2
47
89
3
154
24
25
14
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50284231--50284278
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2.5
20
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64
2
6
27
1.28
50284273--50284334
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2.3
26
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70
51
11
0
37
1.38
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78
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26
22
24
2.00
50287821--50288023
40
5.1
40
82
9
238
26
26
22
25
2.00
50295976--50296176
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50295998--50296176
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1.99
50295998--50296178
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2
142
23
27
22
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410