Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3--341
7
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7
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10
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1.71
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0
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3.0
670
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0
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28348--28382
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2.2
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0
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51
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2.0
71
95
0
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40
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0
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2.4
265
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0
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16
2.3
16
100
0
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29
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1.79
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2.0
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2.0
105
90
0
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2.1
21
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2.4
21
80
6
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80
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2.4
16
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26
26
21
26
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57358--57963
223
2.8
224
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3
1069
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15
14
21
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15
180
47
13
9
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1.75
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2.9
59
72
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150
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1.9
116
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46
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11
29
1.78
61236--61295
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2.3
26
91
0
93
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20
16
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2.1
19
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9
53
35
0
2
61
1.10
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2.1
47
90
5
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32
26
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34
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69842--69997
78
2.0
78
88
0
231
29
23
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
1
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2.0
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5
214
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10
11
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101566--101599
17
2.0
17
100
0
68
41
5
29
23
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105547--105584
19
2.1
19
85
9
53
60
2
2
34
1.24
108244--108270
2
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2
100
0
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0
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21
21
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123973--124541
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86
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1
928
19
24
21
34
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132585--132626
19
2.2
20
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4
59
47
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19
26
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19
1.9
19
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25
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0
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9
43
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2.6
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0
56
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2
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100
0
94
17
17
65
0
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6
100
0
52
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15
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1.20
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30
1.9
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83
9
81
49
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11
24
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182857--182899
20
2.1
21
95
4
79
51
4
4
39
1.44
196185--196218
17
2.1
16
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5
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35
5
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100
0
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1.9
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84
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10
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0
0
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100
0
56
32
32
0
35
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.4
18
84
11
52
40
0
0
59
0.97
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2.8
25
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81
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2
1
53
1.24
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50
2.5
51
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5
190
34
17
21
26
1.95
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0
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2.7
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166
29
15
25
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1.95
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10
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16
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0
0
12
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2.5
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190
34
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21
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1.95
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25
1.98
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7
4.1
7
100
0
58
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27
13
1.82
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2.7
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166
29
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137
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144
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0
40
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
281957--282007
21
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5
20
33
1.76
287504--287531
3
9.3
3
100
0
56
35
0
0
64
0.94
291144--291186
8
5.4
8
86
8
52
62
2
0
34
1.08
291148--291204
15
3.8
15
77
13
55
66
1
1
29
1.12
300570--300873
129
2.4
128
76
8
296
30
13
12
43
1.81
301410--301460
20
2.4
21
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26
54
41
3
3
50
1.39
306856--306923
30
2.3
31
78
14
72
47
7
8
36
1.63
308855--308898
17
2.5
18
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3
63
77
0
18
4
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308864--308916
13
4.0
13
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9
63
75
0
20
3
0.96
311702--311774
36
2.0
36
100
0
146
39
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31
2.1
31
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5
89
30
19
18
31
1.96
320317--320342
10
2.6
10
100
0
52
46
0
30
23
1.53
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21
1.9
20
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15
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10
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17
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2
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37
0
0
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329262--329324
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2.1
29
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1
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1.42
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3.8
86
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5
390
41
17
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1.80
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80
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86
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322
40
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1.80
337516--338046
207
2.6
206
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4
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32
21
13
32
1.92
337866--338347
183
2.6
182
88
2
716
32
18
14
34
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
31
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0
86
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1
1
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27
2.1
27
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0
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33
1.82
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20
2.0
20
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0
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30
25
30
15
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2.0
53
100
0
212
35
20
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0
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2.0
20
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0
0
20
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0
0
17
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231
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17
12
25
1.84
375709--376331
233
2.6
239
79
7
689
43
17
13
26
1.85
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3.6
18
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20
57
53
0
1
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2.0
27
100
0
110
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10
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2.1
15
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12
0
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2.5
232
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1
956
38
22
16
22
1.92
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4
17.2
4
90
0
102
24
4
26
44
1.72
403387--403434
23
2.1
23
84
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62
20
6
14
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7.0
46
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1
444
21
23
14
40
1.90
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51
2.2
51
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167
28
21
10
39
1.87
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232
2.2
232
91
1
837
40
21
15
23
1.91
419374--419454
4
20.2
4
89
0
108
25
4
24
44
1.74
423106--423149
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1.9
24
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9
65
40
0
0
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18
2.2
20
87
8
61
57
0
16
26
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431492--431569
32
2.5
33
81
6
90
32
5
3
58
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
434204--434264
28
2.2
28
100
0
122
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16
6
3
1.17
434217--434295
33
2.4
31
82
12
95
78
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6
3
1.06
434325--434353
11
2.5
12
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11
51
10
41
0
48
1.37
436827--436862
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
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3.7
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284
25
13
22
38
1.91
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258
2.4
258
94
1
1053
26
14
22
36
1.93
442310--442499
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2.6
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4
254
26
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315
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0
1038
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119
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9
378
25
15
22
37
1.93
442619--442782
72
2.3
72
87
5
242
22
15
21
40
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427