Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  295  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85340799--85340861
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24
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0
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1
0
49
1.11
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3.2
40
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26
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1.99
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140
24
28
19
27
1.98
85352509--85352772
140
1.9
141
81
7
322
24
28
18
28
1.98
85357604--85357779
46
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1.8
93
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0
317
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30
22
20
1.98
85363252--85363427
46
3.8
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10
232
28
29
21
20
1.98
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10
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17
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85365767--85365843
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77
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1.8
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46
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27
29
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20
1.98
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2.0
62
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0
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3
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0
66
66
0
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1.12
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12
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0
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0
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1.12
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0
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20
1.14
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22
2.3
24
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70
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1.32
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0
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20
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18
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1.61
85394251--85394289
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
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0
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11
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35
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12
2.8
12
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20
1.82
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40
5.7
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262
25
20
27
27
1.99
85413182--85413368
80
2.4
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11
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27
20
26
25
1.99
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40
3.9
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226
27
20
25
26
1.99
85421363--85421541
80
2.2
80
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222
28
20
25
26
1.99
85424926--85424979
26
2.1
26
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4.2
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22
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2.00
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23
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22
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289
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4.2
40
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2
176
24
27
22
25
2.00
85439672--85439822
80
1.9
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198
23
27
22
25
2.00
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4.2
40
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2
176
24
27
22
25
2.00
85447678--85447828
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
85462543--85462608
27
2.4
27
92
0
105
16
28
36
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1.93
85462543--85462621
27
2.9
27
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17
30
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1.94
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13
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41
25
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23
1.84
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13
2.8
13
92
4
58
31
0
2
65
1.06
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3
7
41
1.48
85466114--85466154
18
2.3
18
83
8
57
58
2
0
39
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85466211--85466263
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0
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0.92
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36
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0
130
23
16
13
46
1.82
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19
2.6
19
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15
66
52
14
4
30
1.59
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43
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43
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300
33
21
15
29
1.94
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16
3.2
16
81
10
68
25
25
3
45
1.71
85479165--85479211
24
1.9
25
83
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4
23
1.33
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60.0
3
73
9
71
62
3
9
24
1.42
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1.9
16
93
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58
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16
22
1.52
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3.2
30
72
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1
9
23
1.34
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15
5.4
14
71
9
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60
1
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1.30
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1.9
15
100
0
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0
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20
1.07
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19
20
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1.97
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2.0
31
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17
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1.94
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28
19
29
23
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20
25
28
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15
28
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1.95
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2.0
29
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0
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Indices
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Percent
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T
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Period
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Copy
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Score
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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182
27
18
30
23
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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