Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  140  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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65
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4
26
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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0
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1.41
37942098--37942138
18
2.3
18
95
0
73
31
0
53
14
1.41
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18
2.4
19
82
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2
0
48
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2.9
80
82
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249
40
21
8
30
1.82
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2.8
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3.0
20
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0
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20
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24
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22
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1.99
37950244--37950386
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3.0
47
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207
28
22
22
26
1.99
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2.0
72
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220
29
22
22
26
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3.1
31
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23
1.91
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6.7
27
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7
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1.79
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2.9
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272
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30
1.82
37953630--37953704
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2.8
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107
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10
26
1.88
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54
6.7
54
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6
160
35
21
9
33
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37953696--37954041
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2.7
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40
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1.83
37953885--37954079
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3.6
54
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0
120
30
22
8
38
1.84
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1.9
25
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0
69
33
25
16
25
1.96
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3.0
20
92
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100
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11
20
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1.89
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6.0
24
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4
200
29
22
21
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1.99
37955480--37955622
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3.0
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89
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198
29
22
21
26
1.99
37955480--37955623
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2.0
72
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211
29
22
21
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1.99
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3.1
31
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23
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2.1
122
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1.82
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0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37994604--37994634
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16
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0
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0
0.77
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21
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10
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17
18
26
37
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93
1.8
93
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2
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29
28
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22
1.98
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177
30
27
19
22
1.98
37996483--37996624
46
3.1
45
73
18
123
29
28
19
23
1.98
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3.4
15
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2
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60
12
18
10
1.59
37998998--37999045
15
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15
79
5
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56
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16
12
1.68
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1.8
91
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28
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22
1.98
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45
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201
29
28
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1.98
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2.0
529
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0
1833
22
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1.98
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0
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26
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4
30
1.32
38015197--38015362
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6.5
25
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3
4
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1.32
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5
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1.99
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1.95
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2.0
42
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0
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53
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0
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22
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2.0
17
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20
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1.87
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26
7.8
28
69
18
109
60
3
4
30
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38024697--38024874
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26
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3
5
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1.95
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1.96
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0
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28
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1.94
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3
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1.95
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28
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1.96
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2.3
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100
0
328
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1.94
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2.7
18
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2
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15
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1.87
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160
2.3
158
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380
36
13
15
34
1.87
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1.67
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3.1
33
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0
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1.98
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1
80
0
72
90
3
6
0
0.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38072762--38072828
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30
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2
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89
2
7
0
0.57
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1
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18
33
1.94
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216
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10
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30
16
19
33
1.94
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5.2
145
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1
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18
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2.5
222
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3
100
0
162
33
0
0
66
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427