Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14217120--14217149
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26
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2.0
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2
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3.0
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1
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20
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2.0
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118
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2
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2.4
30
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72
29
4
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2.0
17
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36
15
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1.9
137
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20
22
13
42
1.87
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6.0
46
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2
300
21
22
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14255287--14255327
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2.2
18
91
4
64
43
0
4
51
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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2
34
1.42
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22
2.3
23
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68
10
0
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1.35
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3
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1.36
14274807--14274993
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34
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11
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4
3
65
1.28
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30
0
2
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10
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36
0
2
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0
0
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93
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20
20
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29
19
21
1.98
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28
29
20
21
1.98
14322834--14322908
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2.0
37
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2.0
356
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5
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32
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80
0
60
43
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22
31
1.64
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3.0
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72
22
113
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20
15
24
1.90
14345499--14345585
41
2.2
40
81
6
95
63
12
4
19
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14346300--14346371
12
6.2
12
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1.15
14346300--14346371
34
2.1
35
85
12
96
47
0
2
50
1.15
14346562--14346650
44
2.0
46
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121
35
21
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37
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2.9
16
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0
58
31
34
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1.58
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2.4
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144
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2.3
45
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134
30
22
12
34
1.92
14371183--14371290
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2.4
44
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144
29
23
13
33
1.93
14378562--14378669
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2.4
44
87
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144
29
23
13
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1.93
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4.9
10
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67
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10
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1.30
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1.53
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14399155--14399407
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118
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24
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24
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66
11
11
19
56
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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19
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.96
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2
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0
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3
0
46
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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