Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  279  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
6
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0
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19
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2.0
132
91
0
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17
22
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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80
9
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18
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1.56
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16
2.0
17
88
11
52
38
11
2
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1.55
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19
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2
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37
1.91
80644384--80645076
127
5.5
126
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659
27
15
19
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583
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18
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29
1.96
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4.2
45
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1.96
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13
212
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17
22
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1.97
80656910--80657241
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19
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1.97
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2.2
171
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5
598
29
18
21
29
1.97
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17
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28
1.96
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1.97
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30
16
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1.97
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18
22
28
1.97
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5.2
125
80
6
626
28
15
18
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80674619--80675311
258
2.7
252
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18
37
1.91
80676250--80676293
18
2.5
18
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3
63
50
36
0
13
1.42
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2.2
13
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51
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0
0
26
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0
0
27
0.85
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2
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1.26
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18
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0
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3
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1.42
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2
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0
0
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18
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1.98
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1.96
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17
21
32
1.96
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2.5
15
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1.35
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11
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5
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0
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54
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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24
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0.98
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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23
24
29
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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