Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  108  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28537554--28537619
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21
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19
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30
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2.2
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3
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222
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44
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44
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28563753--28564026
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31
15
24
28
1.96
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88
3.5
88
78
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295
31
14
24
28
1.95
28563753--28564026
132
2.1
132
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1
352
31
15
24
28
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10
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35
5
0
59
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82
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6
0
60
1.22
28565548--28565605
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2.5
23
80
8
64
32
6
0
60
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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0
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21
2.0
21
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0
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19
29
21
29
1.98
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5
73
15
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0
1
34
1.01
28575143--28575222
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4.5
17
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1
33
1.01
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12
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0
1
34
1.01
28575141--28575242
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3.2
31
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32
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29
3.0
27
83
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100
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0
1
34
1.01
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0
0
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21
1.96
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30
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5
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1.32
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83
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28
2.1
28
80
0
64
25
6
5
62
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
1.96
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3.7
16
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1
49
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2.2
58
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1.37
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9
45
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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10
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40
1.87
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39
2.6
39
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24
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0
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53
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0
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2
93
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3
0
50
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
3
0
61
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28717761--28717814
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54
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1.83
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20
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1.83
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1.83
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20
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1.81
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12.3
27
79
7
210
39
21
8
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427