Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  338  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98618176--98618319
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0
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2.2
23
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0
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0
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50
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0
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1.89
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21
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100
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12
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30
3.2
30
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149
19
27
32
19
1.96
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22
2.4
22
86
0
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7
15
17
59
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
22
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98660261--98660401
26
5.4
26
72
8
108
41
24
12
21
1.88
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15
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51
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10
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2.0
29
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9
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21
21
12
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1.85
98678936--98678987
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23
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22
19
1.95
98687066--98687701
173
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173
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22
22
19
1.95
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44
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36
22
22
18
1.95
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2.0
21
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33
0
2
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1.07
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2.0
46
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0
0
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0
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10
10
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98703793--98703862
33
2.1
33
97
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131
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10
12
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14
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100
0
58
51
0
0
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1.88
98711501--98711604
39
2.7
39
90
0
154
40
23
23
13
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98713383--98713448
21
3.3
21
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12
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48
1.71
98713379--98713457
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2.0
39
100
0
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15
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17
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0
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19
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24
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118
74
18
3
3
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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0
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76
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1.95
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219
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1.94
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4.2
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22
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30
7
18
43
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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29
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1
184
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26
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
416
27
23
17
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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