Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  282  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81352797--81352891
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3.5
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1
114
20
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1.98
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225
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24
1.97
81364608--81365062
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2.1
30
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41
29
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2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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164
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1.96
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2.3
76
86
5
249
32
20
19
27
1.97
81393434--81393468
14
2.5
14
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0
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57
5
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17
1.60
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72
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14
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1.92
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37
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25
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2.3
257
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1042
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2.1
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209
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20
18
28
1.96
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2.0
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20
20
26
1.97
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2.5
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163
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2
912
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20
18
27
1.96
81399697--81400151
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6.3
72
72
12
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1.94
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1.93
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2.5
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50
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2.1
30
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17
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1.95
81405626--81405787
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2.1
75
85
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222
32
20
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81405458--81406113
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4.0
164
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1.96
81405792--81405953
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2.1
77
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240
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20
19
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1.97
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0
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57
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20
17
1.60
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252
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23
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1.94
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14
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1.92
81406397--81406660
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1.92
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257
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2
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0
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0
0
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Indices
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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G
T
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2
0
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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4
1
29
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
23
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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