Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  402  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116632948--116633035
3
29.3
3
72
21
62
65
1
3
29
1.16
116632943--116633041
9
10.2
9
72
20
58
65
1
3
30
1.14
116632948--116633031
12
6.8
12
77
16
75
65
1
3
29
1.17
116632944--116633035
33
2.9
30
73
22
82
65
1
3
30
1.16
116632953--116633012
18
3.2
18
82
13
75
63
1
3
31
1.20
116632987--116633044
12
4.6
13
79
12
59
74
0
1
24
0.92
116633677--116633722
12
3.5
13
80
14
51
10
2
39
47
1.51
116638635--116638810
46
3.8
46
77
12
207
21
20
28
29
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1.8
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93
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28
28
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116643013--116643073
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20.3
3
100
0
122
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0
0
67
0.91
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3
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4
64
26
0
0
73
0.83
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23
2.3
21
82
10
55
36
0
2
61
1.08
116645911--116645965
20
2.7
20
86
11
67
29
1
7
61
1.33
116646808--116646862
21
2.8
21
75
10
62
49
1
3
45
1.30
116650263--116650383
60
2.0
61
93
1
208
26
22
9
41
1.85
116651250--116651280
7
4.4
7
91
0
53
22
32
3
41
1.70
116663328--116663542
46
4.6
46
78
13
215
26
19
31
22
1.98
116663328--116663588
47
5.6
45
82
6
236
27
19
29
22
1.98
116663322--116663588
93
2.9
91
82
8
265
27
19
29
22
1.98
116666088--116666174
21
4.0
23
78
13
94
40
24
20
14
1.90
116666089--116666175
44
2.0
41
82
6
102
39
24
20
16
1.92
116666379--116666511
57
2.5
53
81
12
171
47
30
3
18
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116666379--116666514
29
5.0
28
89
5
183
47
30
3
18
1.65
116670961--116671093
40
3.1
41
83
7
169
48
11
3
36
1.57
116671118--116671220
21
4.7
20
72
20
64
63
0
10
26
1.27
116671143--116671218
26
3.1
26
68
27
76
63
0
11
25
1.28
116671124--116671261
47
3.1
46
82
13
155
62
0
12
25
1.30
116671136--116671227
26
3.7
26
67
20
70
65
0
10
23
1.24
116671119--116671263
40
3.3
42
77
16
136
62
0
11
26
1.30
116671153--116671255
21
4.8
21
73
17
77
61
0
11
27
1.31
116671559--116671599
18
2.2
18
87
12
57
58
0
14
26
1.37
116671663--116671790
21
6.2
21
73
13
86
62
1
10
25
1.37
116671700--116671774
22
3.5
21
80
10
80
62
2
9
25
1.38
116671656--116671772
39
2.8
40
81
12
139
64
1
8
24
1.31
116671657--116671779
43
3.1
37
74
17
102
65
1
9
23
1.32
116671757--116671791
16
2.2
16
94
0
61
57
0
22
20
1.41
116674625--116674796
93
1.8
93
85
2
238
29
29
19
22
1.98
116677153--116677480
90
3.7
89
82
3
390
52
15
6
26
1.66
116677114--116677569
180
2.5
177
75
10
478
53
14
5
26
1.62
116678469--116678588
39
3.1
39
95
0
213
38
22
25
13
1.91
116680791--116680855
27
2.4
27
82
7
80
47
23
3
26
1.66
116681135--116681466
108
3.1
109
78
8
370
31
23
18
26
1.97
116681158--116681545
109
3.6
108
78
7
389
28
23
18
29
1.98
116685785--116685896
36
3.1
35
83
2
134
36
15
13
34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116685785--116685896
18
6.2
18
77
0
116
36
15
13
34
1.86
116686045--116686139
44
2.2
44
82
3
111
37
24
15
22
1.93
116690288--116690320
13
2.3
15
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10
52
54
0
0
45
0.99
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25
2.0
25
100
0
100
16
16
12
56
1.68
116694169--116694220
25
2.1
25
85
0
68
38
15
9
36
1.80
116703271--116703308
3
12.7
3
94
0
67
34
28
2
34
1.71
116703566--116703596
16
1.9
16
93
0
53
6
9
3
80
0.99
116703552--116703590
14
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14
84
7
53
5
10
2
82
0.93
116711380--116711409
14
2.1
15
93
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53
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3
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1.35
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27
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101
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7
7
54
1.55
116719528--116719558
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1.9
16
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25
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100
0
66
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18
18
1.81
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3
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3
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0
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0
0
33
0.92
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22
2.0
21
85
4
57
0
30
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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2
8
79
1.03
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2.3
23
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49
0
7
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1.31
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21
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2
0
48
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0
0
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0
0
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0
0
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0.92
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0
2
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1.11
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0
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1.9
46
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0
178
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1.96
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8
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19
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0
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4
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100
0
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32
0
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18
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1.96
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0
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0
0.95
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1.9
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253
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0
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0
15
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1.48
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15
2.9
15
86
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61
33
0
7
59
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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5
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0
0
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0
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0
0
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0
0
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1.20
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23
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2
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1.22
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2
100
0
54
51
0
48
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.42
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0
0
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0.92
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1
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22
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19
18
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1.95
116966796--116967278
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1.8
266
84
2
664
27
19
18
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427