Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  313  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0
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52
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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37
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91297751--91297791
13
3.2
13
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25
50
36
4
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41
1.71
91297749--91297791
14
3.2
14
75
24
56
37
4
16
41
1.69
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26
2.2
25
83
3
67
37
16
14
32
1.88
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19
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18
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52
37
1
0
60
1.08
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2.0
43
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1
20
24
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1.9
18
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25
8
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1.82
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126
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0
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18
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10
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0
0
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1.00
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0
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1.00
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91352141--91352230
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126
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0
564
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16
19
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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1.98
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27
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0
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13
18
46
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91412555--91412625
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2.0
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0
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40
1.87
91412544--91412625
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1.82
91412799--91412847
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9
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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