Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  265  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76377629--76377697
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24
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2.0
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1.99
76420607--76420790
40
4.7
40
83
8
234
25
28
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
20
26
1.99
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7.6
35
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11
24
31
1.91
76432985--76433251
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2.5
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2
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11
24
32
1.91
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31
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31
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13
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27
2.7
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2.2
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30
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28
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19
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152
22
25
29
22
1.99
76472009--76472232
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20
19
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332
25
14
22
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1.92
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263
2.3
257
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1042
25
14
22
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76485143--76485315
71
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1.93
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2.1
351
99
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37
1.92
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18
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1.97
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166
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18
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1.94
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1.94
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2.3
22
85
3
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53
2
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44
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
10
10
45
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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