Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  50  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12060012--12060590
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3.0
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116
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4
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5
55
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15
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2
5
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10
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4
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0
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20
20
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2.0
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122
19
17
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2.5
65
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192
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10
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19
2.1
20
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57
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26
1.73
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2.3
30
82
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92
54
2
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16
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3
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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3.5
53
71
18
184
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22
14
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2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
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26
1.97
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532
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17
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1.97
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5
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32
16
28
1.96
12090609--12091125
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6.1
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84
6
674
22
32
16
28
1.96
12091088--12091310
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2.6
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1
360
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27
17
27
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22
111
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19
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2.8
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108
41
12
11
34
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
137
97
0
538
31
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19
25
1.98
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4.2
26
97
0
193
36
25
5
32
1.79
12111191--12111215
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10
100
0
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32
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0
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1.9
50
100
0
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18
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29
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2.8
49
83
2
170
25
20
25
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
26
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0
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27
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0
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2.2
18
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29
4
12
53
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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6
9
50
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.60
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2.5
20
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3
68
21
34
3
40
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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