Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  139  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37619773--37619942
23
7.4
24
84
11
239
29
20
20
29
1.98
37619780--37619944
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3.6
47
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268
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19
21
29
1.97
37620000--37620056
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20
3.5
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0
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2.0
241
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2.0
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46
22
0
30
1.58
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20
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23
31
21
23
1.98
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39
3.9
39
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23
32
20
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1.98
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3.5
40
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5
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23
29
23
24
1.99
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6.6
38
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293
27
28
20
24
1.99
37658176--37658434
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295
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27
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24
1.99
37658176--37658433
114
2.2
117
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11
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27
27
20
24
1.99
37658157--37658436
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7.2
40
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27
27
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2.0
611
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3.5
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0
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31
1.91
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11
3.5
11
82
10
51
18
2
2
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37691546--37691678
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2.8
49
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9
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28
1.98
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2
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2
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0
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0
0
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1.8
93
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28
28
19
22
1.98
37701753--37701921
46
3.7
45
75
13
155
29
28
19
22
1.98
37705257--37705315
20
3.0
19
73
7
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45
1
5
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2.0
15
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13
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53
0
0
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2.0
106
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0
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15
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22
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22
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0
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10
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50
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267
26
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1.98
37726548--37726821
95
2.8
98
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293
25
19
31
24
1.98
37726545--37726871
145
2.2
145
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399
25
19
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12
100
0
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16
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143
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24
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1.94
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84
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2
0
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100
0
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14
14
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1.28
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24
5.6
24
75
5
119
26
17
13
42
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37757907--37758041
71
1.9
72
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1
164
26
17
14
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1.88
37758013--37758050
18
2.2
17
90
4
58
23
21
18
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1.95
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42
2.2
42
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132
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20
15
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26
5.3
26
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27
22
22
27
1.99
37760309--37760438
52
2.6
51
93
4
221
27
21
22
28
1.99
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3.4
20
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32
17
10
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37761260--37761324
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2.4
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5
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23
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1.9
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81
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8
22
42
1.82
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54
2.9
54
82
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149
28
9
21
40
1.84
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6.4
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86
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39
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0
22
16
1.35
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1.9
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38
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1.98
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29
3.0
29
80
8
97
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15
17
10
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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37789766--37789842
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77
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20
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28
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0
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8
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28
23
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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83
10
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7
0
38
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37899885--37899933
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0
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40
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2
222
25
26
22
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427