Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  340  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99135004--99135032
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0
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121
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1
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1.58
99136757--99136872
45
2.6
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0
187
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1.58
99136705--99136833
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2.1
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0
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14
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3.0
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40
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27
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1.58
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187
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28
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2.0
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100
0
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23
23
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2
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1.21
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0
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0
0
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39
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2
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3
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.50
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30
3.0
30
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10
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2.4
24
76
18
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46
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5
34
1.66
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18
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24
27
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9
77
12
69
31
0
3
65
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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0
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28
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125
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29
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25
10
1.82
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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29
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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T
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(0-2)
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1
29
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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