Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  354  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102980777--102981200
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135
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1.95
102981436--102981857
167
2.5
168
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1.94
102982198--102982236
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0
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0
20
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2.0
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25
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0
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2.7
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0
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42
2
0
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11
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1
0
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1.06
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1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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127
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103049823--103049870
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3.8
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15
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62
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0
22
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2.1
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0
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2
100
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0
0
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16
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2.0
122
100
0
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0
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1.74
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1.9
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5
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43
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2
32
1.66
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2.6
18
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1.57
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17
0
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1.03
103078634--103078685
23
2.2
22
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17
0
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21
28
28
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3.7
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190
21
21
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10
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0
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2.2
61
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23
2
64
1.35
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2.1
21
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0
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15
39
1.87
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2.1
117
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13
15
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1.87
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2.2
26
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62
54
3
5
36
1.40
103097816--103097876
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3.0
20
72
18
63
47
4
4
42
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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22
0
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1.47
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3.3
26
69
19
79
64
9
22
3
1.39
103102663--103102765
48
2.1
48
98
0
197
66
7
21
3
1.33
103104602--103104636
13
2.7
13
90
0
52
8
37
34
20
1.83
103109087--103109115
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1.9
15
100
0
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31
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27
27
1.94
103109782--103109901
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2.4
51
91
2
188
26
22
11
39
1.88
103111107--103111161
11
5.2
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0
0
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57
1
0
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1.07
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14
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15
25
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1.95
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19
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2.4
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10
24
1.35
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34
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0
140
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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2.4
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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5
210
29
11
24
34
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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