Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  213  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60038046--60038221
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40
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25
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282
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28
1.97
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90
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7
316
23
30
17
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1.97
60055115--60055290
46
3.8
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189
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20
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29
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1.8
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21
29
28
1.98
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26
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0
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150
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30
16
25
1.97
60101059--60101167
29
3.9
28
83
5
123
28
29
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60102076--60102160
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29
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3
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15
27
1.96
60104457--60104743
27
10.6
27
84
0
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19
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1.82
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54
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2
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38
19
8
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1.82
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27
14.3
27
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4
348
38
19
9
32
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4.0
27
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20
26
1.95
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6
11.8
6
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19
18
15
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60105086--60105168
37
2.2
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125
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18
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1.80
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10.6
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20
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1.83
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6.4
52
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7
214
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20
8
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1.83
60107151--60107494
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12.7
27
79
9
128
39
20
8
31
1.83
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5.6
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1.83
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21
23
1.97
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0
234
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21
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1.99
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2.3
79
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22
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1.99
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22
2.8
22
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70
18
21
24
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27
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19
22
20
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1.9
31
96
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18.3
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2.3
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2.1
14
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0
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20
23
30
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1.98
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2.4
42
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127
33
27
14
25
1.94
60124807--60124918
43
2.6
43
83
6
131
33
27
15
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60129473--60129760
40
7.2
40
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23
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25
2.00
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2.0
55
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19
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1.91
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2.3
48
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188
28
26
19
25
1.99
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48
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47
80
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151
28
25
21
24
1.99
60143019--60143476
48
9.7
48
76
12
292
28
17
28
25
1.97
60150924--60151048
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2.7
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155
26
20
28
24
1.99
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17
2.8
19
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32
28
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1.85
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2.1
35
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1.9
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4
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26
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1.59
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2.4
27
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19
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18
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29
21
27
1.98
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22
2.0
22
95
0
77
13
41
16
27
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
50
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24
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24
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87
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0
792
31
27
15
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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821
57
5
8
28
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60286841--60287407
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0
0
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0
0
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10
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24
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0
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38
16
6
38
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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