Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  400  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115941578--115941629
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63
0
1
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0
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0
3
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1.07
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3.0
23
93
0
109
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16
2.2
16
90
0
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30
2
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1.9
30
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7
80
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1
3
49
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2.0
56
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0
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100
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0
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2.0
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2
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0
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15
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0
50
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2
2
41
1.31
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0
0
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17
33
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4.7
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22
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2
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0.90
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1.50
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21
2.2
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4
52
4
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2
59
1.30
115979881--115979931
20
2.6
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50
5
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1
56
1.35
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39
2.4
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0
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35
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24
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3.2
16
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2
0
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2
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2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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26
4.2
26
89
0
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36
25
5
32
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29
2.9
28
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0
3
56
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0
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8
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5
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2.2
19
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2.0
205
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100
0
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0
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25
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0
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0
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2.0
23
100
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20
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41
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1.30
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2.1
49
98
1
201
63
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15
2.7
15
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69
2
2
25
1.14
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9
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8
0
47
44
1.33
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4.9
49
81
2
247
26
17
25
30
1.97
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259
26
17
25
30
1.97
116089609--116089662
21
2.5
22
74
14
58
33
5
0
61
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
24
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0
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40
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1.9
26
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28
2
26
44
1.65
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26
4.2
26
93
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189
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7
24
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1.83
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26
2.9
25
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87
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21
12
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1.90
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27
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27
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133
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21
24
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1.94
116101056--116101169
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2.1
54
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176
17
21
24
36
1.94
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2
100
0
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0
0
50
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100
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18
18
1.84
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0
0
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0
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1.11
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0
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0
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1.9
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5
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6
22
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19
2.1
19
95
0
69
38
10
2
48
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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0
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0
0
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1
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0
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116188964--116189034
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2.3
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13
76
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2
1
39
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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0
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116266403--116266574
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1.8
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0
317
20
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
2
5
51
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427