Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  275  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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29
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20
1.97
79588505--79588673
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4.4
38
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3
223
33
26
20
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
22
31
1.94
79600825--79601855
354
3.0
346
84
5
1308
31
14
22
31
1.94
79603178--79603289
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2.6
42
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2
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25
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16
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29
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32
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29
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10
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33
1.86
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5.0
24
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21
22
26
1.99
79635455--79635573
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170
28
21
22
26
1.99
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2.1
31
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101
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23
1.94
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1.9
25
86
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69
33
25
16
25
1.96
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5.4
11
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20
55
37
11
20
31
1.88
79643417--79643475
19
3.0
20
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111
35
10
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33
1.86
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24
5.0
24
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5
170
28
21
22
26
1.99
79643526--79643644
47
2.5
48
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170
28
21
22
26
1.99
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31
2.1
31
90
3
101
36
15
23
23
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79644987--79645141
42
3.7
40
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1.97
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163
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29
18
26
1.98
79652147--79652317
46
3.7
44
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157
25
29
18
26
1.98
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50
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49
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174
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26
15
26
1.96
79666281--79666571
50
5.8
49
80
7
318
29
26
17
26
1.97
79666284--79666570
101
2.9
99
80
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310
29
26
17
26
1.97
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151
1.9
150
92
0
480
29
26
17
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1.97
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2.0
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18
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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25
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0
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22
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79753673--79753732
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20
41
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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