Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  164  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45563684--45563814
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2.8
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12
164
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19
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29
1.98
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2.6
50
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1
163
26
18
26
28
1.98
45578522--45578697
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
45578519--45578690
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
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1.98
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1.9
16
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0
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19
6
25
48
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202
25
25
23
25
2.00
45589306--45589512
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2.6
80
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25
2.00
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1.9
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25
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55
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1.94
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1.96
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1.9
16
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0
53
41
0
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27
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44
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23
1.93
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2.6
47
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0
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23
26
1.90
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1.94
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16
2.0
16
100
0
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25
1.70
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5.2
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305
25
24
28
21
1.99
45624188--45624371
40
4.6
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75
6
138
26
23
27
22
2.00
45624228--45624416
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
45624955--45625008
26
2.0
27
96
3
101
37
12
25
24
1.91
45632281--45632464
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45632321--45632509
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4
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23
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22
1.99
45638331--45638448
41
3.1
41
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28
98
32
17
28
21
1.96
45638299--45638462
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2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
45645985--45646139
39
4.0
39
91
0
256
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25
28
23
1.99
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30
2.0
30
90
0
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28
25
8
38
1.84
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3.0
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28
19
21
1.98
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30
2.0
30
90
0
93
30
25
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36
1.85
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2.4
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0
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12
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1.83
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46
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12
212
28
17
30
23
1.97
45673124--45673216
28
3.3
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4
118
24
11
32
31
1.91
45677765--45677864
28
3.6
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10
130
27
14
33
26
1.94
45682502--45682590
28
3.1
29
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101
23
13
35
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1.92
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18
1.9
18
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52
41
11
17
29
1.85
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49
4.5
49
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372
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30
30
1.87
45688130--45688244
37
3.1
37
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0
212
26
19
33
21
1.97
45690965--45691131
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4.2
40
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2
176
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27
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45690965--45691131
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2.1
79
83
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205
24
27
22
25
2.00
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40
6.3
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355
25
24
28
22
1.99
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40
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90
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385
25
24
28
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1.99
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0
0
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1.29
45731694--45731843
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2.2
67
81
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171
32
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45731718--45731901
67
2.8
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194
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17
29
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1.97
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6.8
6
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0
0
78
0.76
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17
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83
12
59
21
0
0
78
0.76
45735077--45735156
12
6.8
11
72
19
56
25
2
0
72
0.97
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3.1
16
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31
4
0
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1.12
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27
2.6
27
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104
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25
14
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1.95
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42
2.5
42
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194
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1.94
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97
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3.7
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17
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2.1
19
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176
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16
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16
100
0
72
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11
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16
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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29
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39
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2
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1.96
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39
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1
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101
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0
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1.9
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1.97
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1.97
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0
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22
17
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
1.98
45842795--45843006
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1.98
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19
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1.81
45871694--45871880
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2.2
84
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5
261
48
14
17
20
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45871998--45872063
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2.5
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1.92
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1.95
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28
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42
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4
153
31
24
18
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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