Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  175  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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25
22
30
22
1.99
48755784--48755936
39
3.9
39
92
0
243
24
20
31
23
1.98
48755785--48755967
39
4.6
39
88
0
240
24
22
30
22
1.99
48755791--48756005
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177
25
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18
25
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.99
48784377--48784783
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20
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26
25
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114
29
26
13
29
1.94
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214
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26
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1.98
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2.0
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24
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1.87
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2.4
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20
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1.97
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20
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20
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1.97
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4.6
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20
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1.79
48828273--48828396
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2.3
54
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20
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1.79
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1.9
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220
40
19
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30
1.83
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16
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1.89
48828273--48828423
54
2.8
54
85
4
162
41
19
9
29
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
48829060--48829156
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30
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Percent
Indels
Score
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3
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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T
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
33
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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