Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  239  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67761464--67761795
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9
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28
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1.92
67761622--67761811
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303
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1.84
67761627--67761811
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3.8
48
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291
35
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37
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32
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19
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1.95
67762965--67763236
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57
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0
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1.16
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0
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44
2.1
44
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127
25
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30
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3.7
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0
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5.0
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2
56
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15
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24
2.6
23
77
12
61
34
16
16
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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4
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24
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71
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2.0
22
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28
19
29
22
1.98
67811073--67811430
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7.6
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13
300
28
19
29
22
1.98
67811069--67811430
140
2.6
142
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7
400
28
19
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1.98
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20.5
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0
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0
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2.5
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217
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1.64
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3.3
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44
1.40
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492
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1.97
67851958--67852284
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501
29
26
17
25
1.97
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2.2
148
97
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32
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34
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26
2.9
26
78
7
73
65
0
4
30
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67866374--67866417
17
2.6
16
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2
34
1.07
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2.1
16
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1.31
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2.9
43
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23
1.99
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24
27
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2.00
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2.2
30
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19
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18
1.62
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2.2
21
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19
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14
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0
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0
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0
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1
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18
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24
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1.97
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12
100
0
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15
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28
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27
69
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134
31
34
16
17
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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77
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26
26
11
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1.91
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18
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130
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1.80
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13
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26
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16
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38
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0
147
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7
23
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2.3
52
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5
163
33
15
14
36
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68026443--68026492
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2.0
25
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0
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32
7
24
36
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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