Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  288  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82742703--82742810
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0
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0
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0
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1.95
82747805--82748432
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2.3
267
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29
4.6
29
82
1
140
25
32
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2.1
81
77
2
180
34
7
20
38
1.81
82791983--82792233
54
4.6
54
92
0
403
39
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1.84
82795862--82795974
21
5.4
21
86
0
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15
22
16
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.60
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46
2.8
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22
29
28
1.98
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25
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82841632--82841694
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3.0
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33
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17
1.68
82841899--82842004
28
4.0
28
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24
16
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1.95
82845702--82845934
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2.3
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2.4
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3
43
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16
2.7
16
81
3
50
52
2
0
45
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82857572--82857621
24
2.1
24
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0
100
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2.0
19
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1.97
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16
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13
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4.6
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26
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19
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1.98
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2.1
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1.94
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25
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6.7
32
69
11
101
32
15
24
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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39
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27
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25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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22
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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