Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  66  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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71
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285
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83
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13
8
47
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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25
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24
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2.1
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2.6
26
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20
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2.0
207
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20
20
35
1.96
16270480--16270884
69
5.9
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299
23
20
20
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16282864--16282920
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0
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13
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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22
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0
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39
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201
8
41
34
15
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16404282--16404350
9
7.7
9
73
12
61
2
49
28
18
1.62
16404282--16404344
18
3.5
18
84
4
74
1
50
28
19
1.56
16405987--16406018
15
2.1
16
88
11
50
50
0
0
50
1.00
16410959--16410986
13
2.2
13
100
0
56
28
32
7
32
1.84
16422794--16422840
22
2.2
21
88
3
67
65
0
4
29
1.11
16422941--16422973
15
2.1
16
88
5
50
57
6
12
24
1.57
16423395--16423488
49
2.0
49
89
4
147
44
3
6
45
1.45
16430912--16430969
10
6.3
9
77
15
57
36
0
1
62
1.06
16431532--16431612
42
1.9
42
100
0
162
29
28
12
29
1.93
16433314--16433369
27
2.1
27
100
0
112
48
14
0
37
1.44
16433971--16434005
2
18.5
2
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11
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54
0
0
45
0.99
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13
3.5
13
80
11
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15
8
8
67
1.41
16437284--16437412
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4.3
30
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8
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45
3
20
30
1.69
16437343--16437399
17
3.6
17
67
23
52
43
1
19
35
1.61
16441430--16441477
24
2.0
24
100
0
96
25
4
29
41
1.74
16445370--16445437
9
7.6
9
89
0
109
44
19
10
26
1.82
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6
11.2
6
76
14
70
21
1
2
74
1.03
16445456--16445525
32
2.2
31
85
7
88
21
1
2
74
1.03
16445527--16445570
13
3.6
13
82
17
58
9
2
47
40
1.48
16447074--16447119
19
2.3
20
92
3
76
26
10
15
47
1.78
16447200--16447241
22
1.9
22
100
0
84
50
0
0
50
1.00
16451886--16452024
46
3.0
46
90
2
199
20
23
14
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16451902--16452039
46
3.0
46
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0
222
22
23
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39
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15
3.6
14
75
14
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5
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3
80
0.99
16457569--16457637
34
2.1
33
86
8
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42
2
1
53
1.24
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26
2.1
26
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0
99
57
11
9
22
1.61
16478987--16479041
27
2.0
27
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13
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1
29
21
1.61
16481476--16481508
14
2.4
14
100
0
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12
30
9
48
1.71
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154
2.0
154
99
0
603
29
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9
44
1.79
16488543--16488640
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3.0
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1.83
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25
3.3
25
63
27
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29
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19
41
1.81
16490816--16490916
49
2.1
49
100
0
202
30
12
17
38
1.88
16500408--16500623
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4.5
49
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5
160
27
27
18
27
1.98
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0
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0
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0
0
90
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0
0
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0.54
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0
0
50
1.00
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0
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0.87
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20
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1
40
1.28
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2.4
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3
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42
18
18
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1.90
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100
0
70
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20
0
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1.51
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2.0
15
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53
0
29
0
70
0.87
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3
13.3
3
94
0
71
67
2
0
30
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16515081--16515137
20
2.8
20
82
15
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54
1
1
42
1.21
16516253--16516292
20
2.0
20
100
0
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25
25
10
40
1.86
16527878--16527954
38
2.0
38
97
0
145
38
23
10
27
1.87
16528958--16529057
35
2.9
35
78
0
110
45
21
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26
1.79
16528876--16529058
70
2.6
71
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176
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19
9
30
1.82
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13
100
0
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1.78
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0
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1.82
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0
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7
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32
1.84
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19
2.5
18
83
10
58
61
0
0
38
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427