Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10123378--10123420
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2.0
21
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2
2
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1.59
10123623--10123664
2
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2
82
4
50
42
2
2
52
1.27
10123610--10123658
21
2.4
20
86
3
62
36
2
6
55
1.37
10123787--10123830
12
3.7
12
82
11
63
29
6
4
59
1.44
10124234--10124389
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10.0
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245
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66
0
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25
1.19
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0
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1
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15
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101
2.1
102
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28
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2.1
30
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22
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27
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23
2.4
24
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11
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50
8
7
33
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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8
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15
2.9
15
89
3
52
56
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9
29
1.50
10169216--10169252
14
2.4
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13
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59
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15
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0
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51
58
6
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2.4
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20.6
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2.1
43
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110
38
1
12
48
1.48
10186721--10186865
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3.4
44
74
21
144
38
2
12
46
1.56
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1.9
18
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5
52
35
5
8
50
1.58
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0
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1.11
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2234
38
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13
35
1.83
10188711--10188739
15
1.9
15
100
0
58
48
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1.74
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183
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15
26
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2.1
133
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494
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18
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1.97
10194038--10194171
26
5.2
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223
36
24
4
34
1.76
10194047--10194172
25
5.1
22
92
3
108
37
25
3
33
1.75
10197968--10198178
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3.2
64
62
20
151
30
26
17
26
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2.1
136
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0
527
31
25
18
24
1.97
10199999--10200133
26
5.2
26
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227
37
23
5
34
1.77
10201274--10201326
26
2.0
26
100
0
106
52
18
11
16
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10205067--10205299
23
10.1
23
80
6
188
38
23
6
32
1.79
10205067--10205299
46
5.1
45
74
10
211
38
23
6
32
1.79
10205065--10205299
92
2.5
91
83
6
271
38
23
5
32
1.79
10206225--10206440
23
9.4
23
76
12
203
39
22
5
32
1.77
10209705--10209763
29
2.0
29
100
0
118
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22
3
27
1.67
10209819--10209861
21
2.0
21
82
8
52
32
46
2
18
1.62
10209867--10209904
15
2.6
14
80
19
51
44
39
0
15
1.47
10209860--10209909
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2.3
21
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3
64
46
34
0
20
1.51
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184
1.9
183
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2
481
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19
20
28
1.97
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2.0
433
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0
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1.90
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23
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1.95
10215300--10215414
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2.1
54
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23
23
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1.95
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2.8
26
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30
14
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1.94
10217028--10217132
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4.2
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1.80
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23
22
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10221068--10221182
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2.1
54
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23
22
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25
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35
1.79
10226044--10226151
26
4.2
26
93
0
180
36
24
6
33
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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10278073--10278124
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5
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0.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
36
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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172
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11
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1.74
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0
0
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0
0
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0.93
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23
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0
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0
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1.39
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2.0
61
95
0
215
38
6
20
34
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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