Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  346  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100678440--100678492
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2.9
18
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0
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26
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0
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1.46
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1.94
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26
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0
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0
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29
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2.1
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81
36
1
1
60
1.16
100730359--100730425
30
2.2
32
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15
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37
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1
59
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2.4
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42
5
0
51
1.25
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3.3
40
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2
160
33
24
16
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
77
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22
19
34
1.96
100750477--100750628
28
5.4
28
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3
128
23
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5
53
1.65
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34
2.2
34
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37
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9
43
1.70
100750927--100750991
34
1.9
34
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6
114
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9
9
44
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0
66
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62
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10
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23
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29
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4
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0
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0
0
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2.7
21
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0
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10
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27
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2.1
22
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0
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0
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0.59
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11
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50
0
8
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15
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16
27
1.93
100777568--100777629
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2.1
30
90
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99
41
29
9
19
1.83
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54
51
5
14
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1.65
100777777--100778307
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6.8
73
75
13
411
33
19
17
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100777974--100778450
165
2.9
168
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725
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18
29
1.96
100778146--100778307
74
2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
100778311--100778450
74
1.9
75
89
3
219
27
23
20
28
1.99
100778250--100778852
212
2.9
209
81
10
663
35
21
16
26
1.94
100778515--100778680
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2.3
71
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4
244
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21
15
22
1.89
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3.8
70
84
5
345
38
22
14
25
1.91
100778518--100779109
262
2.3
257
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14
25
1.93
100778680--100778942
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1.9
140
89
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411
38
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14
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2.0
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48
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0
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39
14
31
1.87
100798005--100798110
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1.9
56
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0
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39
3
5
50
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19
2.7
20
73
5
54
35
15
0
49
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
0
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0
0
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18
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216
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20
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23
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8
0
59
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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59
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56
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0
189
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12
3
36
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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197
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0
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21
0
31
47
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427