Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  60  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14673351--14673440
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0
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10
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19
1.96
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24
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25
22
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22
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200
25
26
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27
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2.6
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24
26
21
26
2.00
14721898--14722081
40
4.6
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4
210
23
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2.6
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10
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1
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0
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1.55
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12
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0
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2.5
35
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10
1
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9
100
0
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0
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2.3
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36
0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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18
2.4
19
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3
65
8
11
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71
1.32
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18
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17
78
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33
2
4
60
1.27
14731453--14731505
16
2.9
17
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30
7
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58
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16
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0
0
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2.0
22
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19
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2.1
31
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17
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1.46
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0
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43
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3
53
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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51
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0
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1.00
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16
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11
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0
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2.0
21
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5
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14786438--14786500
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60
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53
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3
0
35
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14803461--14803489
12
2.5
12
94
5
51
0
31
10
58
1.31
14806900--14806930
14
2.2
14
94
0
53
54
0
0
45
0.99
14806914--14806958
23
1.9
23
86
4
63
55
2
0
42
1.12
14807855--14807899
2
22.5
2
100
0
90
51
0
0
48
1.00
14810689--14810851
51
3.2
51
93
0
272
31
14
23
30
1.94
14818490--14818519
7
4.3
7
95
0
51
36
3
30
30
1.74
14818446--14818560
51
2.3
51
92
0
185
32
14
23
29
1.94
14826166--14826204
20
2.0
20
84
0
51
51
7
7
33
1.59
14829180--14829412
104
2.2
103
85
5
308
22
20
32
24
1.98
14833149--14833259
32
3.4
32
72
14
93
37
4
9
48
1.55
14834003--14834065
30
2.1
30
100
0
126
15
17
25
41
1.89
14834329--14834369
21
2.0
20
90
4
64
19
4
19
56
1.60
14839029--14839075
21
2.2
21
77
7
51
17
21
14
46
1.83
14856779--14856808
3
10.0
3
92
0
51
63
0
3
33
1.11
14857021--14857081
11
5.7
11
74
14
56
59
1
1
37
1.17
14857005--14857050
23
1.9
23
86
8
65
63
2
0
34
1.07
14857021--14857061
16
2.6
16
92
3
66
58
2
0
39
1.11
14858174--14858209
12
3.1
12
92
8
56
86
0
11
2
0.68
14859630--14859752
41
2.9
41
81
7
122
30
20
23
26
1.99
14860712--14860790
41
1.9
41
86
0
113
30
20
21
27
1.98
14872950--14873003
3
18.0
3
96
0
99
64
0
1
33
1.04
14873166--14873273
35
3.0
37
80
15
93
60
2
3
33
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14873200--14873243
11
4.1
11
82
11
56
65
2
0
31
1.05
14873213--14873273
20
3.1
20
76
17
65
62
1
1
34
1.15
14873204--14873275
37
1.9
37
83
5
92
61
2
1
34
1.19
14873466--14873522
24
2.4
24
81
0
69
61
8
3
26
1.42
14874376--14874425
25
2.0
25
100
0
100
32
24
16
28
1.96
14875491--14875560
29
2.4
29
85
4
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40
0
4
55
1.19
14878890--14878955
29
2.2
31
80
15
77
30
6
3
60
1.36
14886111--14886154
22
1.9
24
82
17
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2
6
38
1.41
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3.9
11
80
11
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0
2
62
1.08
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5.0
40
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36
16
24
22
1.95
14888844--14889052
46
4.7
46
82
10
247
37
16
23
22
1.94
14888796--14889008
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2.5
84
95
0
381
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16
24
23
1.94
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51
2.1
51
91
0
171
35
5
23
36
1.78
14889598--14889705
26
4.2
26
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35
5
23
36
1.78
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2.5
22
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61
0
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30
1.23
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2.1
56
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20
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16
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48
1.63
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18
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0
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14
25
22
1.92
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46
4.3
46
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1
279
39
14
24
21
1.90
14908985--14909227
138
1.8
130
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335
39
14
24
22
1.91
14911906--14911937
16
2.0
16
93
0
55
65
6
6
21
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14912031--14912137
51
2.1
51
96
0
196
36
19
16
27
1.93
14918617--14918649
17
1.9
17
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50
21
6
0
72
1.05
14919776--14919907
18
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18
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13
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10
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1.82
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26
2.0
26
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0
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1.76
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45
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0
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0
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0
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2.0
16
100
0
64
87
0
12
0
0.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427