Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  69  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17124628--17124780
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20
23
15
1.91
17141249--17141358
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1.9
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27
1.84
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22
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1.99
17151792--17151959
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3.6
47
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293
28
20
22
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1.98
17151771--17151959
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2.7
71
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310
28
21
22
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3.5
20
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0
124
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21
11
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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2.0
24
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2.7
27
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19.6
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20
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1.99
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23
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22
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22
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21
21
28
1.99
17216317--17216441
46
2.6
48
87
7
166
28
21
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17216529--17216588
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1.86
17216529--17216583
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5.4
11
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55
30
20
10
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1.87
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16
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23
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1.93
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1.99
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3.0
20
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23
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24
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22
22
26
1.99
17239124--17239306
64
2.7
67
85
11
239
27
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17239124--17239306
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2.0
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8
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27
22
22
26
1.99
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20
3.2
20
93
0
112
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21
9
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1.85
17239357--17239411
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0
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0
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1.00
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1.98
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24
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1.93
17274573--17274738
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54
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24
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1.93
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1.93
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0.00
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23
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2.0
28
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3
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0
1
57
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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26
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90
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2
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1.99
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132
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23
18
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427