Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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0.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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25
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
0
0
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2.4
27
85
12
82
32
0
1
65
1.02
12718687--12718752
30
2.3
27
85
12
80
33
0
1
65
1.02
12718839--12718881
22
1.9
23
85
4
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74
2
0
23
0.93
12718836--12718892
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1
0
21
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62
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0
243
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3
38
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3
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12
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4
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1.51
12723509--12723551
18
2.3
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4
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18
2.1
18
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0
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44
13
7
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1.72
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1.9
20
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5
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20
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33
1.51
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0
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0
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1.00
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2
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0
0
50
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0
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14
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2.1
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0
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12756954--12757000
20
2.5
19
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10
78
53
0
4
42
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12758053--12758092
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30
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0
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2
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2
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1.33
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2
20.5
2
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0
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27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12797991--12798150
26
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26
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5
34
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12797991--12798150
51
3.1
51
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2
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36
23
5
34
1.78
12797991--12798150
77
2.1
77
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0
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20
2.3
20
85
7
58
32
8
19
39
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427