Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  333  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97112658--97112724
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1
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2
10
0
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0.67
97112660--97112724
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9
78
16
69
3
10
0
86
0.69
97112658--97112724
12
5.2
13
75
8
66
2
10
0
86
0.67
97112658--97112724
31
2.2
29
87
12
100
2
10
0
86
0.67
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19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
97118359--97118420
19
3.2
19
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4
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1.9
62
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28
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21
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14
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1.92
97125652--97125759
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2.0
53
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3
128
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22
24
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7.7
27
82
0
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19
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30
1.79
97128820--97129035
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4.0
54
90
0
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40
19
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31
1.80
97128823--97129032
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2.6
82
83
1
280
41
18
7
31
1.79
97128993--97129615
27
23.3
27
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2
720
36
18
20
24
1.95
97128829--97129062
54
4.4
51
83
6
261
41
19
8
29
1.81
97128993--97129615
107
5.8
108
85
2
720
36
18
20
24
1.95
97129028--97129613
80
7.3
81
82
7
561
36
18
21
24
1.95
97130042--97130106
22
3.0
22
75
8
60
20
20
24
35
1.96
97130265--97130365
27
3.7
27
82
5
123
19
23
18
37
1.94
97130265--97130366
54
1.9
53
85
2
141
19
23
19
37
1.94
97130491--97130589
6
16.3
6
80
10
112
21
15
14
49
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97138821--97138882
25
2.4
26
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15
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54
8
3
33
1.46
97140561--97140678
27
4.4
27
75
4
112
42
16
24
16
1.88
97140561--97140678
54
2.2
54
84
3
148
42
16
24
16
1.88
97145883--97145973
25
3.6
24
80
5
83
30
18
21
28
1.97
97145864--97145969
50
2.1
50
84
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135
28
18
21
31
1.97
97149407--97149459
27
2.0
27
96
0
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28
11
24
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1.90
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11
3.5
11
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6
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5
43
1.38
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568
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26
25
22
2.00
97152403--97152911
183
2.8
184
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616
25
25
25
22
2.00
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0
62
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0
0
48
1.00
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15
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14
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55
0
0
45
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13
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55
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0
0
29
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12
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0
53
74
0
25
0
0.82
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16
2.5
16
87
4
53
46
0
2
51
1.14
97160359--97160391
12
2.6
13
85
4
50
42
0
0
57
0.98
97173441--97173495
3
17.7
3
78
17
51
65
3
1
29
1.20
97173441--97173495
24
2.3
25
81
9
71
65
3
1
29
1.20
97174022--97174067
26
1.9
23
83
16
58
36
15
4
43
1.66
97174904--97175039
44
3.1
44
77
10
111
30
24
16
29
1.96
97174981--97175202
44
4.9
44
74
7
165
31
19
15
33
1.93
97174981--97175254
139
2.0
139
85
1
370
31
18
15
34
1.92
97175175--97175302
51
2.5
51
80
0
139
30
14
18
35
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97175330--97176348
44
22.5
44
69
10
318
31
19
16
33
1.94
97175486--97175512
13
2.1
13
100
0
54
14
22
14
48
1.81
97175617--97176348
88
8.2
89
75
6
441
31
19
15
32
1.94
97175601--97176090
133
3.7
133
77
3
531
30
19
16
33
1.93
97175601--97176206
265
2.3
270
83
4
744
31
20
15
33
1.93
97175878--97176312
228
1.9
227
86
1
620
32
19
15
32
1.93
97179956--97180000
17
2.8
17
78
18
51
26
0
17
55
1.42
97181209--97181331
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1.9
65
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3
149
28
28
21
21
1.99
97184562--97184881
46
7.0
46
94
0
525
22
23
15
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1.92
97187237--97187304
30
2.3
30
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5
84
27
19
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47
1.72
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2.1
24
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10
61
36
11
3
48
1.58
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2.2
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59
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0
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0
0.80
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20
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0.81
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1.91
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17
24
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25
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1.97
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25
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95
21
25
20
32
1.97
97218629--97218750
50
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149
21
24
20
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1.97
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25
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25
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20
24
20
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1.97
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235
26
24
20
28
1.99
97222488--97222526
18
2.2
18
100
0
78
17
5
12
64
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
2
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1.12
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1
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1.9
35
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1
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1.10
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2
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1.26
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1.04
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0
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20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
2
41
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1
3
62
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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