Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  300  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86964287--86964325
17
2.4
17
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8
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66
2
2
28
1.18
86964822--86964869
25
1.9
25
83
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39
2
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1.44
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30
2.1
30
93
0
108
55
14
3
26
1.54
86966817--86966875
23
2.6
23
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0
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22
15
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1.68
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18
3.7
18
95
0
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13
13
39
1.84
86977928--86977988
13
4.7
13
85
0
86
37
29
8
24
1.84
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21
2.0
21
85
0
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51
29
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14
1.63
86979863--86979929
14
4.7
14
81
3
71
41
5
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1.71
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20
2.0
20
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0
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14
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22
3.7
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62
47
0
1
51
1.08
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31
2.0
30
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50
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1
38
1.43
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130
2.0
127
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4
357
36
18
17
27
1.93
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130
2.3
129
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350
36
17
16
28
1.92
86998784--86998994
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3.2
64
62
20
151
29
26
18
26
1.98
86998750--86999036
137
2.1
137
98
0
556
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25
19
24
1.98
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0
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1.81
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3
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0
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66
0
0
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0.92
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3
46.7
3
71
15
83
62
1
7
28
1.30
87002316--87002413
20
4.9
20
75
12
76
61
2
7
29
1.34
87002451--87002484
14
2.3
15
90
5
52
61
5
11
20
1.50
87002457--87002503
15
3.1
15
81
6
51
63
4
10
21
1.43
87002477--87002518
12
3.5
12
81
12
50
59
0
9
30
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87002498--87002536
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2.6
15
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8
53
58
2
7
30
1.39
87004752--87004879
40
3.2
40
81
8
118
35
23
17
24
1.95
87004928--87005021
40
2.3
40
85
0
116
30
17
20
31
1.95
87004776--87005184
156
2.7
145
81
7
439
31
21
18
28
1.97
87005093--87005214
41
3.0
40
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140
31
19
20
28
1.97
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13
2.8
13
91
0
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18
0
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29
1.47
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13
2.6
13
85
0
50
20
0
26
52
1.46
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18
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2
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41
1.67
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7
6.7
7
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60
20
0
35
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1.52
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1.8
84
86
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38
11
19
30
1.87
87006722--87006861
72
2.0
71
87
7
203
38
10
20
30
1.87
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27
2.2
27
79
5
68
36
5
5
53
1.45
87009874--87010090
9
24.8
9
70
16
93
47
14
1
35
1.53
87009882--87010123
16
15.0
16
69
13
97
48
14
1
35
1.52
87009869--87010096
64
3.6
64
89
0
357
48
15
1
35
1.53
87019854--87019882
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
87020295--87020346
21
2.5
21
93
0
86
26
19
50
3
1.65
87020736--87020845
43
2.5
43
89
1
157
25
28
20
26
1.99
87024136--87024265
40
3.2
40
83
2
172
25
28
23
23
1.99
87024152--87024301
80
1.9
80
83
2
194
22
28
24
25
2.00
87029205--87029282
39
2.0
39
92
0
129
21
15
34
28
1.94
87034715--87034747
3
10.7
3
93
6
57
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87036151--87036243
27
3.3
27
77
8
89
18
5
33
43
1.73
87047250--87047456
55
3.8
53
77
7
211
33
15
26
23
1.95
87047258--87047456
108
1.8
110
85
4
287
33
16
26
23
1.95
87047572--87047627
23
2.4
23
93
0
94
46
7
23
23
1.76
87047698--87047728
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
87050081--87050334
93
2.7
89
77
8
231
24
29
18
27
1.98
87053951--87053980
15
1.9
16
93
6
53
23
6
20
50
1.71
87055498--87055525
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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2.1
17
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10
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8
16
0
1.04
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1.9
27
84
0
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19
9
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1.84
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0
0
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1.00
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1.46
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2.8
29
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121
34
18
0
47
1.49
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2.0
21
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0
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0
112
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7
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1.83
Indices
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Score
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1.47
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Period
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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28
28
16
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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