Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  376  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109350385--109350419
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2.0
26
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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23
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16
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1.8
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62
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144
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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1.9
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1
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2.1
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33
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2
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1
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30
1.92
109453923--109453951
12
2.3
13
94
5
51
34
0
13
51
1.42
109460700--109460831
62
2.2
59
82
5
149
40
3
6
50
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
45
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4
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34
13
24
27
1.93
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29
2.6
29
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0
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20
16
16
47
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2
100
0
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0
0
50
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4
2
29
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2
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0
0.79
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5
0
51
1.25
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8
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14
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19
1.88
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19
1.91
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0
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1.97
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0
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23
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1.45
109534814--109534851
15
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2
20.0
2
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2
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21
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109537329--109537478
21
7.0
21
85
3
138
40
22
20
16
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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2.0
224
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0
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133
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0
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25
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1.98
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2.0
666
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1
1968
25
25
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1.98
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1.8
127
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0
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0
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1.95
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72
16
4
4
74
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109611581--109611614
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14
0
2
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0.79
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100
0
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1.93
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31
1.93
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105
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96
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0
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35
13
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427