Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  106  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28039277--28039303
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0
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2.0
43
80
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20
23
1.98
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1.96
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1.8
128
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28
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24
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3.4
38
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101
28
28
20
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2.1
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5
9.0
5
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13
51
56
2
0
41
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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19
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62
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0
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18
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18
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2
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28109127--28109165
18
2.1
19
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53
51
2
0
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1.14
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21
2.0
22
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6
0
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1.22
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57
33
6
0
60
1.22
28109770--28109823
21
2.7
19
83
16
65
31
5
0
62
1.18
28111760--28111832
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0
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0
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79
68
1
8
21
1.25
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11
100
0
50
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0
0
72
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34
10
25
29
1.90
28140879--28140946
28
2.3
30
90
10
122
22
30
27
19
1.97
28142034--28142099
29
2.2
30
91
2
107
24
4
25
45
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28146249--28146287
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2.4
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56
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32
26
18
22
1.97
28151564--28151724
85
1.9
85
82
10
204
32
26
18
22
1.97
28158713--28158831
44
2.8
43
83
8
145
31
26
19
22
1.98
28158665--28158831
43
3.9
42
80
8
149
32
24
17
24
1.97
28158982--28159023
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14.0
3
100
0
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0
0
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2.4
16
84
16
53
56
0
12
30
1.37
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0
65
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2
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0
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1.06
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1.11
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1.15
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2
1
61
1.14
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26
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1.34
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56
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4
157
38
21
22
16
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
18
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6
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0
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18
18
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2
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0
0
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47
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0
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28180761--28180812
16
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16
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5
50
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3
403
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27
23
23
2.00
28184932--28185235
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23
2.00
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119
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23
2.00
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27
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28
1.96
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0
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22
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23
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1.99
28209112--28209354
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3.0
80
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23
23
28
25
1.99
28209112--28209354
119
2.0
120
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23
23
28
25
1.99
28211467--28211525
25
2.5
25
83
8
79
54
1
1
42
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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2
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23
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1.99
28219792--28220031
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2.0
118
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27
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22
23
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25
1.99
28230471--28230712
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2.0
119
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22
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1.99
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2.5
25
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22
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22
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20
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93
93
0
299
28
30
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28249217--28249255
21
1.9
21
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13
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0
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1.75
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1.93
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392
20
17
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1.93
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4.7
29
98
0
252
25
16
33
24
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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