Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  39  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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1.40
Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
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A
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(0-2)
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326
20
21
21
36
1.95
9855346--9855637
132
2.2
133
95
1
525
20
20
21
37
1.94
9855609--9855997
129
3.0
130
79
10
447
20
22
21
36
1.95
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66
1.9
66
96
0
236
35
11
19
33
1.88
9857258--9857292
14
2.5
14
95
0
61
20
20
2
57
1.54
9857037--9857570
73
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75
16
324
29
17
19
32
1.95
9857349--9857637
162
1.8
157
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5
427
30
16
19
33
1.94
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16
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0
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0
50
1.00
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1.26
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210
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210
90
0
937
32
14
20
32
1.92
9866493--9866560
35
2.0
35
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2
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35
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10
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10
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2
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1.25
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2.0
84
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15
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1.90
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3
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58
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31
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9881421--9881778
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88
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0
518
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1.98
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44
7.1
44
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1.99
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45
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1.97
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43
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12
326
20
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20
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1.97
9882061--9882820
44
17.4
43
64
12
253
20
25
20
33
1.97
9882019--9882870
87
9.7
87
90
3
1237
21
24
20
33
1.97
9886952--9887132
44
4.1
44
68
11
136
29
16
27
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9886952--9887264
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132
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1
430
30
16
25
27
1.97
9887208--9887300
44
2.1
44
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0
150
30
15
29
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1.95
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20
2.8
20
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2
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18
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3
69
1.30
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22
2.2
23
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7
57
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2
2
48
1.24
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0
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1.22
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0
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1.18
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3.9
88
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23
19
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1.98
9896469--9896909
132
3.3
132
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26
23
19
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1.98
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2.1
176
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0
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23
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1.98
9896489--9896850
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88
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19
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1.98
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1.98
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1.98
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68
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303
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20
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1.9
174
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20
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132
4.5
132
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22
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1.9
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18
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9
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19
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1.9
66
96
0
236
35
11
19
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9899140--9899174
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2.5
14
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0
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20
20
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3.3
72
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7
288
28
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1.95
9899373--9899407
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2.7
13
90
0
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14
14
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156
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16
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1.9
85
83
4
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30
15
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2.9
210
90
0
919
32
14
20
32
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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