Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6908889--6909065
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4.2
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6908889--6909065
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83
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20
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1.80
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2.0
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2.0
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130
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20
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2.0
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0
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331
25
19
20
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1.97
6943370--6943640
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2.1
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44
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2.8
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22
0
8
69
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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1.94
6973112--6973202
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0
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2.1
24
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1.55
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1.53
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2.5
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5
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1.45
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3
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122
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1
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1.22
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0
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10
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1.9
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12
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1.38
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15
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53
26
6
0
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1.16
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2.3
15
95
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17
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2.1
30
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3
3
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1.33
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4.5
40
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27
22
25
25
2.00
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2.0
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2.2
24
82
0
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15
2.9
15
76
23
54
26
11
2
59
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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1.11
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2.2
21
88
3
67
44
12
17
25
1.84
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4.9
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11
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2.3
72
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118
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10
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1.02
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56
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0
5
25
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7058255--7058299
23
2.0
23
82
8
56
68
4
2
24
1.19
7059517--7059613
32
3.0
32
92
0
167
32
7
22
37
1.82
7061097--7061149
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
7064022--7064540
131
4.0
128
78
6
463
34
18
18
27
1.95
7063954--7064553
130
4.6
131
79
5
498
34
19
18
28
1.95
7066643--7066671
14
2.0
15
93
6
51
65
6
6
20
1.40
7070599--7070804
64
3.1
64
62
21
150
30
25
17
26
1.98
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137
2.1
137
96
0
529
32
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24
1.97
7072630--7072725
26
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26
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0
156
36
22
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33
1.82
7072630--7072737
52
2.1
52
91
0
171
37
23
7
32
1.82
7072630--7072737
26
4.2
26
85
7
148
37
23
7
32
1.82
7077725--7078009
136
2.1
136
98
0
552
31
25
18
24
1.98
7079788--7079944
26
6.2
26
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5
232
36
23
6
33
1.80
7079788--7079944
51
3.1
50
94
3
269
36
23
6
33
1.80
7082862--7082914
26
2.0
27
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74
24
15
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7084377--7084436
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1.9
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0
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40
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5
33
1.75
7087267--7087318
17
2.8
19
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11
54
51
3
7
36
1.49
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20
2.0
20
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0
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15
0
37
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1.45
7091063--7091107
23
2.0
23
95
0
81
24
2
17
55
1.53
7094826--7094858
15
2.1
16
88
5
50
27
15
6
51
1.66
7094964--7095089
61
2.1
61
80
3
137
42
13
4
39
1.65
7098832--7098982
43
3.5
43
89
3
248
23
29
23
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7099122--7099169
19
2.5
19
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12
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72
4
2
20
1.11
7099155--7099202
17
2.6
18
80
12
53
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2
4
27
1.21
7111764--7111864
23
4.4
22
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7
121
35
23
5
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1.79
7111764--7111900
46
3.0
46
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2
186
37
21
5
35
1.78
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3.2
26
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150
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4
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1.77
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46
6.5
46
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5
327
37
24
5
33
1.78
7114973--7115281
23
13.4
23
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283
36
24
5
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1.78
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1.73
7116066--7116110
14
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15
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1.74
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15
2.4
15
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0
54
27
19
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1.79
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2
100
0
90
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0
0
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5
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2.0
21
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0
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17
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21
2.3
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14
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1.35
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2
261
30
15
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21
2.5
21
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30
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28
1.88
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3
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3
81
7
67
31
1
0
66
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7136525--7136581
14
4.2
14
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8
73
31
1
0
66
1.02
7136531--7136585
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2.1
26
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0
110
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3
0
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19
2.0
19
100
0
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10
26
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1.90
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100
0
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0
0
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0
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0
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0
0
20
0.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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