Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  392  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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1
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1.20
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60
1.20
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3.6
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56
1.40
113680936--113681021
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1.9
45
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1.40
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2.0
26
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2.1
19
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0
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25
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2.4
204
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2.0
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75
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60
1.21
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35
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2
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2.4
45
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2
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2.9
29
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34
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1
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1.35
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177
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1
1408
30
22
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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354
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1.97
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4.5
12
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25
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62
2
0
35
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2.5
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2.3
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1.16
113725578--113725622
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22
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100
0
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18
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20
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2.8
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25
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10
59
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3.3
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23
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25
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1.98
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25
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68
39
15
7
37
1.77
113776613--113776665
11
4.6
11
84
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70
35
0
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62
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3.7
46
90
0
254
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15
23
19
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6.1
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57
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24
21
1.89
113783257--113783576
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3.5
92
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13
24
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1.89
113783267--113783576
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2.2
138
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1.90
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79
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216
20
21
29
28
1.98
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1.8
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17
20
24
1.94
113831072--113831166
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9
113
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16
25
32
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9.0
43
89
2
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24
16
28
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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2.0
77
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25
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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27
1
0
70
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
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36
0
13
50
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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