Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  320  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93220438--93220660
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40
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24
2.00
93220438--93220660
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2.00
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22
1.98
93230954--93231127
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1.8
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20
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1.98
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19
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22
1.98
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1.99
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25
2.00
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26
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22
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1.9
147
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28
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0
50
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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24
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0
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22
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129
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19
22
1.98
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27
0
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0
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1.41
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93279643--93279884
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335
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1.50
93282841--93282887
22
2.2
21
88
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48
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23
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0
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20
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1.98
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2.7
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1
163
28
24
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93285902--93286121
45
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173
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1.97
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138
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20
17
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1.96
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138
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25
17
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1.97
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0
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0
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0
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0
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57
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1.9
33
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1
9
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1.37
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34
85
11
91
60
1
9
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1.36
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25
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70
20
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2
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27
1.34
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15
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64
65
0
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25
1.24
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5
127
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25
16
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1.96
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28
25
15
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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T
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35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
16
39
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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