Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  289  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83091718--83092553
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2.1
22
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39
0
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1.48
83095729--83095764
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3.0
12
83
0
54
8
11
52
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1.65
83097846--83097956
44
2.5
44
89
0
159
31
22
14
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1.94
83100664--83100733
25
2.8
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2
113
25
15
27
31
1.96
83100692--83100757
23
2.8
23
86
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78
31
13
25
28
1.94
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22
3.4
22
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1.92
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2.0
25
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22
1.9
22
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17
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1.80
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10
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47
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130
25
29
18
26
1.98
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25
2.1
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100
0
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21
2.5
21
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3
90
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1.42
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29
2.1
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20
1.74
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39
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24
25
24
25
2.00
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2.1
31
88
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50
19
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1.74
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2.4
14
94
0
57
36
0
18
45
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83179626--83180113
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69
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4
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20
21
38
1.93
83179625--83180081
138
3.3
139
79
6
455
18
20
21
39
1.93
83190623--83190668
10
4.6
10
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10
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21
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2
67
1.29
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122
2.0
123
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18
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1.97
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6.1
41
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18
23
1.96
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42
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41
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7
117
32
20
18
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1.96
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15
2.3
15
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17
0
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1
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21
3.1
21
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1
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1.63
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2.0
93
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240
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9
26
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1.88
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2.2
16
89
0
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14
14
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2.2
24
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19
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7
0
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1.28
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19.6
9
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0
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6.9
27
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210
46
22
0
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1.52
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2.1
31
100
0
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12
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32
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100
0
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18
0
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1.51
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31
20
25
1.98
83206928--83207198
94
2.9
91
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316
21
31
20
25
1.98
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180
3.7
176
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7
748
29
25
16
29
1.96
83220101--83220201
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2.3
43
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1.95
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147
2.9
147
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2
567
26
26
16
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83220889--83220991
45
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120
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15
26
1.95
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3.2
13
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7
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0
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0
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2.1
21
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0
294
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18
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31
1.97
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100
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1
274
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18
15
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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68
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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