Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  414  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120301592--120301626
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1.9
18
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0
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0
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0
0
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48
20
21
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0
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39
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1.9
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2
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2.0
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0
0
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2.0
19
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4
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4.5
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61
0
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30
1.23
120320484--120320544
21
2.9
21
83
13
81
63
0
6
29
1.19
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3
5
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15
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15
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0
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2
35
1.39
120320870--120320917
3
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2
6
25
1.26
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10
3.9
10
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53
20
2
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120321498--120321537
21
1.9
21
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0
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20
2
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72
1.15
120323300--120323351
3
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3
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11
81
28
0
0
71
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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0
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16
13
1.72
120324078--120324186
18
6.1
18
69
10
71
47
17
17
17
1.83
120324149--120324197
6
8.2
6
90
0
80
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18
18
1.80
120325318--120325348
5
6.0
5
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53
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0
0
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2.7
28
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4.2
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26
36
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4.0
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0
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0
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0
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8.0
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74
10
51
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0
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30
1.01
120359859--120359914
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2.8
20
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2
67
66
0
1
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1.03
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2.0
25
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38
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2.0
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1
41
1.30
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2.0
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5
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30
1.51
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429
2.2
427
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2
1598
56
5
7
30
1.50
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148
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5
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30
1.50
120380149--120380289
72
2.0
72
84
2
185
19
25
20
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120380799--120380837
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10
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1.72
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3.7
15
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1
29
0
68
1.00
120384874--120384919
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2.4
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85
10
58
0
30
0
69
0.89
120384879--120384931
25
2.1
26
85
3
72
1
32
0
66
1.03
120385080--120385117
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1.9
19
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67
5
10
10
73
1.23
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10
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34
2
0
62
1.08
120386268--120386327
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2.1
28
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18
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10
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1.46
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4
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1.38
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19
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21
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6
55
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0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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12
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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57
0
12
29
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.3
38
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6
95
25
23
26
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427