Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  418  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121455558--121455588
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1.9
16
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0
53
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0
3
54
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2.0
23
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68
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2
1.02
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3.5
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169
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1.88
121462256--121462429
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2.4
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10
212
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22
11
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244
2.0
244
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0
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25
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1.9
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1.98
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79
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193
29
29
19
21
1.98
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3.1
46
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120
29
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230
23
20
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32
1.98
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2.6
44
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19
35
1.95
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3.5
38
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16
107
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1
0
50
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3.5
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0
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1.00
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0
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39
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0
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1.9
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57
5
0
37
1.21
121523915--121523957
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2.0
20
82
8
50
60
0
6
32
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121528179--121528225
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2
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121529232--121529271
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2.0
20
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0
25
0
75
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15
2.0
16
93
6
55
0
12
12
74
1.08
121529292--121529322
8
4.0
8
91
8
55
0
12
12
74
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2.0
17
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2.0
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0
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3.5
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11
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40
5
0
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2.1
22
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1.50
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1.41
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2.1
18
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51
52
2
5
39
1.38
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13
2.3
13
94
0
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50
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13
30
1.67
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38
2.1
38
100
0
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30
2.1
30
90
0
99
57
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3
23
1.53
121562431--121562633
102
2.0
100
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232
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9
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1.56
121570260--121570325
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2.1
32
94
0
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37
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18
28
1.91
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13.2
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419
15
26
15
43
1.86
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3.3
175
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622
15
26
15
43
1.86
121571018--121571355
132
2.5
134
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5
317
15
26
15
42
1.87
121571018--121571595
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87
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11
348
15
26
15
43
1.86
121571288--121571595
126
2.4
126
80
7
318
14
24
15
45
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
16
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1.57
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2.4
59
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263
29
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13
15
1.85
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26
5.2
26
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1
236
37
25
4
33
1.76
121578341--121578475
51
2.6
51
96
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243
37
25
4
33
1.76
121584158--121584292
26
5.2
26
94
1
227
36
25
5
33
1.78
121584158--121584292
51
2.6
52
96
1
245
36
25
5
33
1.78
121585590--121585639
20
2.6
19
75
15
57
52
2
0
46
1.12
121585626--121585676
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2.5
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1.45
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2.0
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1.66
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13
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1.78
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2.0
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0
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0
0
56
0.99
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28
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56
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58
2.0
58
100
0
234
29
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57
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1
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0
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0
73
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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23
12
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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0
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1.98
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20
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1.9
96
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4
267
58
2
23
16
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427